- Sức ép cạnh tranh các doanh nghiệp trong ngành trên thị trường ngày càng lớn, họ thường xuyên tung ra những chiến thuật mới nhằm thâu tóm thị trường, đặc biệt thị trường trong nước.
- Hình thức thu hoạch cà phê hạt nước ta ở trình độ thấp ảnh hưởng không tốt đến chất lượng nguyên liệu cũng như sản phẩm. Hiện nay theo thống kê ngành cà phê Việt Nam có đến 88% nông dân thu hoạch cà phê theo phương pháp hàng loạt nghĩa là khi thu hoạch người dân thu hoạch cả quả chín lẫn quả xanh, trong quá trình trồng, người dân sử dụng, phân bón, thuốc kháng sinh, thuốc tăng trưởng không đúng cách chiếm đến 50%. Bên cạnh đó, đến năm 2008 tỷ lệ vườn cà phê già cỗi (từ 20 – 25 năm) trở lên chiếm 22% trong khi đótyr lệ vườn cà phê dưới 12 năm tuổi chỉ chiếm 50%.Đồng thời giá cả cà phê trên thị không ổn định, phụ thuộc lớn vào sự biến động giá ở thị trường cà phê New York, Brazil,.., chất lượng cà phê còn ảnh hưởng mạnh yếu tố thời tiết. Mặt khác, phương pháp thu mua tại Việt Nam chủ yếu theo hình thức cũ dựa trên kích thước hạt và tỷ lệ hạt đen vỡ, trong khi thế giới đã sử dụng phương pháp tính số lượng lỗ trên tổng khối lượng và phân loại lỗi theo tiêu chí Cup Test (tỷ lệ lỗi về độ sạch theo tiêu chuẩn thử nấm).
- Hệ thống thông tin về giá cả, sản lượng, chất lượng và những vấn đề liên quan dến cà phê nguyên liệu và thành phẩm tại Việt Nam chưa được phổ biến rộng rãi, sàn giao dịch cà phê mới chỉ xuất hiện ở Thành phố Hồ Chí Minh, thậm chí tại nơi được gọi là “Thủ phủ cà phê” như Đăk Lăk cũng chưa xuất hiện, điều này càng làm phổ biến hơn tình trạng “mù thông tin” cho nông dân cũng như các DN trong ngành.
- Công tác kiểm tra giám sát và những quy định về an toàn vệ sinh thực phẩm của ngành chế biến nói chung và ngành sản xuất cà phê nói riêng chưa chặt chẽ và đồng bộ, chỉ dừng lại ở mức là quy định, còn khâu thực hiện chưa cụ thể, rõ rang, do đó làm cho một số DN chủ quan trong vấn đề này, ở Mê Trang cũng là một trong số đó.
- Những quy định pháp luật về cạnh tranh, các chính sách như: vay vốn,.. chưa cụ thể và còn mang nặng tính chất hành chính, rườm rà tạo nên khó khăn cho kinh doanh các DN trong nghành, đặc biệt DN nhỏ như Mê Trang.