Cơ chế chính sách đầu tư chưa hợp lý mới chú trọng đầu tư xây dựng công trình mới, đầu tư xây dựng công trình đầu mối chưa chú trọng đến việc nâng cấp tu bổ công trình, hiện đại hóa hệ thống nên việc các công trình thiếu đồng bộ đã ảnh hưởng đến QLCT, cơ chế chính sách chưa đồng bộ còn nhiều bất cập. Nhiều hệ thống CTTL lớn được xây dựng xong công trình đầu mối, kênh chính nhưng còn thiếu công trình điều tiết nước, kênh mương nội đồng nên chưa khai thác hết năng lực theo thiết kế. Mới đây ngày 02/5/2014, UBND tỉnh đã ban hành Quyết định số 635/QĐ-UBND về việc phê duyệt phân cấp quản lý, khai thác công trình thuỷ lợi trên địa bàn tỉnh Thái Bình, trong đó phân cấp: đối với những công trình có năng lực tưới từ 5ha trở lên giao cho Công ty TNHH MTV khai thác thủy lợi Bắc Thái Bình quản lý; đối với những công trình có năng lực tưới dưới 5ha giao cho UBND các huyện, thị xã quản lý. Tuy nhiên, thực tế có một số công trình thuỷ lợi thuộc địa bàn liên xã, nếu giao cho huyện quản lý là chưa hợp lý điển hình như công trình ở xã Hồng Việt nhưng dẫn nước phục vụ sản xuất cho xã Lô Giang, xã Hồng Việt không được hưởng lợi, nếu giao một phần cho xã Hồng Việt quản lý là rất khó khăn.
Đầu năm 2015, UBND tỉnh ban hành quy định về mức thu tiền nước, mức trần phí dịch vụ lấy nước, danh mục công trình, biện pháp tưới và vị trí cống đầu kênh đối với các công trình thuỷ lợi trên địa bàn tỉnh Thái Bình. Tuy nhiên, không quy định mức thu phí dịch vụ lấy nước của các tổ dùng nước để phục vụ cho mục đích sản xuất nông nghiệp nên các địa phương không có căn cứ tổ chức thực hiện.
Hộp 4.2. Không quy định mức thu phí dịch vụ lấy nước sau cống đầu kênh
Năm 2015 UBND tỉnh Thái Bình có ban hành quyết định số 672/ QĐ- UBND về mức thu tiền thủy lợi phí ở vị trí cống đầu kênh, nhưng lại không nói rõ mức thu phí thủy lợi phần sau cống đầu kênh nên không thu được thủy lợi phí của các tổ chức lấy nước phần sau cống đầu kênh. Điều này làm cho các xã tự định mức thủy lợi phí dẫn tới làm lợi cho một số cán bộ.
Nguồn: Phỏng vấn Ông Nguyễn Văn Thuận, cán bộ xã Thụy Trường, Thái Thụy(2017)