Ngân hàng Nông nghiệp và Phát triển nông thôn Việt Nam chi nhánh thành phố Hồ Chí Minh tiền thân là chi nhánh Ngân hàng phát triển nông nghiệp Thành phố Hồ Chí Minh trực thuộc Ngân hàng phát triển Nông nghiệp (NHPTNo), được thành lập theo Quyết định 110/NH-QĐ/TCCB ngày 12/10/1988 của Tổng Giám đốc Ngân hàng Nhà nước (NHNN) Việt Nam (hiện nay là thống đốc NHNN Việt Nam).
Chi nhánh NHPTNo TP. HồChí Minh có các chi nhánh trực thuộc: - Chi nhánh 1 trụsởtại huyện Bình Chánh
- Chi nhánh 2 trụsởtại huyện Hóc Môn. - Chi nhánh 3 trụsởtại huyện Củchi.
- Chi nhánh 4 trụsởtại huyện Nhà Bè. - Chi nhánh 5 trụsởtại huyện Cần Giờ.
Chi nhánh NHPTNo TP. HồChí Minh hoạt động theo quy chếtạm thời vềtổ chức và hoạt động của NHPTNo Việt Nam; thực hiện hoạch toán kinh tế, có tư cách pháp nhân, có con dấu riêng và có các phòng, ban chỉ đạo và hoạt động nghiệp vụ tại Hội sở.
Sau khi có pháp lệnh Ngân hàng, hợp tác xã tín dụng và công ty tài chính của Hội đồng Bộ trưởng (nay là chính phủ) ban hành ngày 23/5/1990 và Quyết định số 400/TC ngày 14/11/1900 của Chủ tịch Hội đồng Bộ trưởng về thành lập NHPTNo Việt Nam thành các chi nhánh là chi nhánh NHPTNo tỉnh, thành phố… Lúc này tên là chi nhánh NHPTNo TP. HồChí Minh.
Đến đầu năm 1995 Ngân hàng Nông nghiệp Việt Nam tổ chức thí điểm mô hình Ngân hàng Nông nghiệp 2 cấp tại TP. Hà Nội và TP. Hồ Chí Minh. Và theo quyết định số 603/NH-QĐ ngày 22/12/1990 của Thống đốc ngân hàng Nhà Nước Việt Nam thành lập chi nhánh Ngân Hàng Nông Nghiệp trực thuộc văn phòng Đại diên Miền Nam.
Thực hiện quyết định số 36 NHNo/QĐ ngày 15/5/1995 của Tổng Giám đốc NHNo Việt Nam, Chi nhánh NHNo 50 Bến Chương Dương ra đời.
Ngày 02/06/1988 Thống đốc NHNN Việt Nam ban hành Quyết định số 198/1988/QĐ-NHNN thành lập các đơn vị thành viên hoạch toán phụ thuộc của NHNo, Chi nhánh NHNo 50 Bến Chương Dương trực thuộc NHNo Việt Nam.
Và để củng cố thương hiệu chi nhánh đã đề nghị với NHNo Việt Nam xin được đổi tên gọi. Quyết định số 242/QĐ/HĐQT-TCCB ngày 19/8/2003 của Tổng Giám đốc NHNo Việt Nam đổi tên chi nhánh NHNo Bến Chương Dương thành:
- Tên gọi tiếng Anh: Vietnam Bank For Agriculture And Rural Development Ho Chi Minh City Branch.
- Tên gọi tiếng việt: Chi nhánh Ngân hàng Nông nghiệp và phát triển Nông Thôn Thành PhốHồChí Minh.
- Trụ sở: Số 2A Phó Đức Chính, Phường Nguyễn Thái Bình, Quận 1, TP.HCM.Chi nhánh Agribank TP.Hồ Chí Minh là đơn vị được xếp hạng Doang nghiệp Nhà nước hạng I, có con dấu riêng để hoạt động kinh doanh, được tổ chức và hoạt động theo quy chếtểchức và hoạt động của Agribank Việt Nam.