Nhiệm vụ hoàn thuế tại Cục thuế Đồng Nai, do phòng Kê Khai và Kế toán thuế của Cục Thuế đảm nhiệm.
Theo Quyết định 502/QĐ-TCT và Thông tư 99/2016/TT-BTC, quy trình hoàn thuế giá trị gia tăng (GTGT) được thực hiện như sau
Bước 1 Người nộp thuế (NNT) tự xác định số thuế GTGT đủ điều kiện được hoàn, lập và gửi hồ sơ hoàn thuế đến cơ quan quản lý thuế trực tiếp.
- Hồ sơ hoàn thuế bao gồm Giấy đề nghị hoàn trả khoản thu ngân sách nhà nước (mẫu 01/ĐNHT ban hành kèm theo Thông tư 156/2013/TT-BTC) và các tài liệu khác theo quy định tại các điều từ Điều 50 đến Điều 56 (trừ Điều 53) của Thông tư số 156/2013/TT-BTC.
- NNT nộp hồ sơ trực tiếp tại cơ quan thuế hoặc gửi điện tử hoặc gửi quan đường bưu điện
Bước 2 Cơ quan thuế tiếp nhận và phân loại hồ sơ theo quy định tại Điều 12 Thông tư này.
Bước 3 Cơ quan thuế xác định số thuế GTGT được hoàn
- Đối với hồ sơ hoàn thuế thuộc diện hoàn thuế trước kiểm tra sau, cơ quan thuế đối chiếu hồ sơ hoàn thuế và hồ sơ kê khai thuế để xác định số thuế GTGT được hoàn.
Trong thời hạn 03 ngày làm việc nếu hồ sơ hoàn thuế không thuộc đối tượng và trường hợp được hoàn hoặc chưa đủ thông tin để xác định thì cơ quan thuế gửi thông báo cho NNT.
- Đối với hồ sơ hoàn thuế thuộc diện kiểm tra trước hoàn thuế sau, cơ quan thuế thực hiện kiểm tra, thanh tra tại cơ sở NNT để xác định số thuế GTGT được hoàn.
Bước 4 Cơ quan thuế xác định số tiền thuế, tiền chậm nộp, tiền phạt và các khoản thu khác còn nợ ngân sách nhà nước để thực hiện bù trừ với số tiền thuế GTGT được hoàn, lập đề xuất hoàn thuế và dự thảo Quyết định hoàn thuế.
Bước 5 Cơ quan thuế thẩm định hồ sơ hoàn thuế trước khi ban hành Quyết định hoàn thuế.
Thời hạn ban hành Quyết định hoàn thuế/Quyết định hoàn thuế kiêm bù trừ thu NSNN chậm nhất không quá 06 (sáu) ngày làm việc đối với hồ sơ hoàn thuế thuộc diện hoàn thuế trước, kiểm tra sau; 40 (bốn mươi) ngày đối với hồ sơ hoàn thuế thuộc diện kiểm tra trước, hoàn thuế sau kể từ ngày nhận được đủ hồ sơ hoàn thuế của người nộp thuế.
Bước 6 Chi hoàn thuế
Căn cứ Quyết định hoàn thuế/ Quyết định hoàn thuế kiêm bù trừ khoản thu ngân sách nhà nước, Cục Thuế thực hiện lập Lệnh hoàn trả khoản thu ngân sách nhà nước/ Lệnh hoàn trả kiêm bù trừ khoản thu NSNN (ban hành kèm theo Thông tư 08/2013/TT-BTC) gửi Kho bạc nhà nước cấp tỉnh kèm theo Quyết định hoàn thuế/Quyết định hoàn thuế kiêm bù trừ khoản thu ngân sách nhà nước.
Kho bạc Nhà nước cấp tỉnh thực hiện hoàn thuế cho người nộp thuế trong thời hạn chậm nhất 03 (ba) ngày làm việc kể từ ngày nhận được Lệnh hoàn trả khoản thu ngân sách nhà nước/ Lệnh hoàn trả kiêm bù trừ khoản thu ngân sách nhà nước do cơ quan thuế chuyển đến.