+ Về quy chế CTNB: Quy chế CTNB của KBNN Long An vẫn phải căn cứ chế độ, tiêu chuẩn, định mức chi hiện hành do Nhà nước, Bộ Tài chính, KBNN ban hành, do đó khi ban hành quy chế thì phải đợi hướng dẫn của cấp trên nên chưa kịp thời, mức chi, chế độ chi, tiêu chuẩn định mức trong Quy chế CTNB không được vượt quá chế độ, định mức quy định trường hợp Quy chế CTNB xây dựng vượt chế độ, tiêu chuẩn, định mức do cơ quan có thẩm quyền ban hành sẽ bị cơ quan quản lý cấp trên như KBNN, Bộ Tài chính, thanh tra, Kiểm toán Nhà nước xuất toán và yêu cầu điều chỉnh lại cho phù hợp, các định mức của Nhà nước như phụ cấp của công chức làm việc trong môi trường độc hại, chi tiếp khách, chi hội nghị, định mức mua sắm tài sản thiết bị văn phòng của nhà nước đưa ra rất thấp so với giá cả trên thị trường nên gây nhiều khó khăn trong quá trình thực hiện.
kinh phí. KBNN Long An là một tỉnh có 5 huyện trực thuộc giáp biên giới Campuchia, điều kiện đi lại về trung tâm tỉnh xa, cuộc sống của công chức khó khăn, giá cả các mặt hàng thiết yếu đắt đỏ, nắng nóng kéo dài. Vì vậy, nhiều khoản chi phát sinh thực tế là rất cần thiết như: chi hỗ trợ công chức ở những vùng khó khăn, chi chênh lệch giá cả... Tuy nhiên, những khoản chi này lại chưa được Nhà nước và các cơ quan có thẩm quyền ban hành chế độ, định mức để chi; trường hợp vận dụng chế độ, định mức để chi thì sẽ bị cơ quan quản lý cấp trên như KBNN, Bộ Tài chính, cơ quan thanh tra, kiểm toán “xuất toán” do chế độ không quy định.
+ Về chế độ hóa đơn, chứng từ: Theo quy định thì khi thực hiện chi kinh phí phải bảo đảm có chứng từ, hóa đơn hợp pháp, hợp lệ; trong khi đó, để giảm khối lượng công việc, giảm thủ tục hành chính không cần thiết, KBNN Long An nói riêng và hệ thống KBNN nói chung có thể thực hiện khoán đối với một số nội dung chi khác của đơn vị (cước phí điện thoại công vụ, văn phòng phẩm phục vụ cho chuyên môn, xăng dầu…). Tuy nhiên, khi thực hiện khoán các nội dung này vẫn phải tập hợp đầy đủ hóa đơn, chứng từ theo quy định. Thực hiện quy định này sẽ rất khó cho việc thanh toán các nội dung có thể giao khoán nêu trên.
+ Về xác định kinh phí tiết kiệm: Khi thực hiện mô hình kế toán nội bộ tập trung KBNN tỉnh là đơn vị dự toán cấp 3, KBNN huyện là đơn vị báo sổ, thực hiện chi theo nhiệm vụ được giao, dự toán hàng năm được chia theo quí để sử dụng. Cuối quý, khi thực hiện xác định kinh phí tiết kiệm còn một số nhiệm vụ chưa thực hiện được hoặc đang thực hiện dở dang, KBNN tỉnh không thể biết được từng nhiệm vụ chi của KBNN Huyện, chỉ xác định số liệu để trích tiết kiệm trên cơ sở chứng từ của KBNN huyện đã chuyển về KBNN tỉnh hạch toán vào sổ sách kế toán nên dẫn đến tình trạng xác định số liệu chi tại thời điểm trích kinh phí tiết kiệm chưa được chính xác.
+ Về kinh phí tiết kiệm: Khi thực hiện mô hình KTNB tập trung để tạo tính chủ động sử dụng kinh phí tiết kiệm được, KBNN Huyện được sử dụng 50% kinh phí tiết kiệm được để chi BSTN cho công chức 50% còn lại phải chuyển về để điều hòa chung toàn tỉnh. Như vậy, chưa khuyến khích các đơn vị huyện tiết kiệm vì họ không được sử dụng 100% số tiền tiết kiệm được, công tác hạch toán vất vả vì huyện phải chuyển kinh phí về tỉnh, tỉnh thực hiện tính toán số chi BSTN toàn tỉnh không quá 0,2 lần mức lương và hạch toán chi.
+ Về luân chuyển chứng từ : Khi thực hiện kế toán nội bộ tập trung toàn bộ chứng từ KBNN huyện, thị khi hoàn thành nhiệm vụ chi được giao xong phải chuyển về KBNN tỉnh để kiểm tra, ghi sổ kế toán trong quá trình vận chuyển chứng từ về KBNN tỉnh nhất là những KBNN huyện vùng sâu, vùng xa biên giới cách xa trung tâm tỉnh có thể xảy ra trường hợp mất, hư hỏng chứng từ khi gặp thời tiết mưa, bão.
+ Về giao nhiệm vụ chi cho KBNN Huyện, thị: Thực hiện công văn 2518/KBNN-TVQT ngày 07/10/2014 của KBNN V/v triển khai KTNB tập trung tại KBNN cấp tỉnh, KBNN huyện không được giao nhiệm vụ chi mua sắm công cụ dụng cụ lâu dài khi có nhu cầu hoặc công cụ dụng cụ bị hư hỏng đột xuất phải đề nghị về tỉnh mua sắm, cấp hiện vật dẫn đến tình trạng không kịp thời, việc mua sắm nhỏ lẻ nhất là đối với một số huyện vùng sâu, vùng xa, phát sinh chi phí vận nhiều, việc mua sắm tập trung không mang lại hiệu quả cao.
Với các điểm nêu trên, Giám đốc KBNN tỉnh mặc dù được giao quyền tự chủ nhưng cũng không thể phê duyệt, quyết định các nội dung, mức chi vượt quy định hiện hành, khó có thể quyết định khoán các nội dung chi hoạt động thường xuyên ngoài quy định của Nhà nước, kể cả từ nguồn kinh phí tiết kiệm được. Điều này có thể gây bị động trong công tác tổ chức thực hiện nhiệm vụ chuyên môn của KBNN tại địa phương.