Vai trò của Vụ kiểm toán nội bộ là giúp Tổng kiểm toán thực hiện kiểm toán một cách độc lập đối với tất cả các đơn vị của ngân hàng. Tổng kiểm toán do Tổng thống bổ nhiệm trên cơ sở đề nghị của Bộ trưởng Bộ Kinh tế và Tài chính cho một nhiệm kỳ ba năm và có thể được bổ nhiệm lại trong nhiệm kỳ tiếp theo. Theo Luật ngân hàng Hàn Quốc, Tổng kiểm toán thực hiện kiểm toán định kỳ và báo cáo kết quả kiểm toán lên Hội đồng chính sách tiền tệ quốc gia ngay khi kết thúc mỗi cuộc kiểm toán.
Vụ kiểm toán nội bộ có nhiệm vụ kiểm tra, xác nhận việc quản lý tài sản và đồ vật có giá trị của ngân hàng; hoạt động phù hợp với luật pháp, quy định và các chỉ thị, hướng dẫn trong hoạt động ngân hàng; chuẩn bị cho việc cải tiến các thao tác nghiệp vụ nếu cần thiết; khuyến khích việc nhìn nhận tính hiệu quả của kiểm soát nội bộ.
Quy chế về nhiệm vụ của Tổng kiểm toán ngân hàng Hàn Quốc quy định có ba loại kiểm toán chủ yếu được Hội đồng chính sách tiền tệ quốc gia
phê chuẩn là: kiểm toán thông thường, kiểm toán đặc biệt và kiểm toán thường ngày.
* Một số kết luận về hiệu quả hoạt động kiểm toán nội bộ Ngân hàng Trung ương Hàn Quốc:
+ Có sự phối hợp chặt chẽ giữa Kiểm toán nội bộ với các Tổ chức kiểm toán bên ngoài (Uỷ ban kiểm toán tối cao, Thanh tra Hàn Quốc) trong việc thực hiện kiểm toán Ngân hàng Trung ương Hàn Quốc. Do đó, tạo điều kiện cho việc lập kế hoạch kiểm toán phù hợp, tránh chồng chéo, trùng lắp trong quá trình thực hiện kiểm toán. Đây là cơ sở để tiết kiệm chi phí dành cho kiểm toán và nâng cao hiệu quả hoạt động kiểm toán nội bộ.
+ Tính khách quan, độc lập trong quá trình hoạt động của Vụ Kiểm toán nội bộ được đảm bảo, Vụ Kiểm toán nội bộ chịu sự chỉ đạo trực tiếp của Tổng Kiểm toán (là người do Tổng thống bổ nhiệm) thực hiện kiểm toán một cách độc lập đối với tất cả các đơn vị của ngân hàng. Do đó, các kiểm toán viên không bị chi phối, tác động khi đưa ra các tồn tại, sai phạm và kiến nghị các biện pháp xử lý.
+ Công tác lập kế hoạch kiểm toán của Vụ Kiểm toán nội bộ được tập trung vào những vấn đề trọng tâm, trọng điểm trong từng thời kỳ, những lĩnh vực có rủi ro cao của ngân hàng. Do Tổng kiểm toán (người trực tiếp chỉ đạo Vụ Kiểm toán nội bộ) được Uỷ ban kiểm toán (bao gồm những kiểm toán viên cấp cao) tham mưu trong việc đưa ra những quyết định liên quan đến những vấn đề quan trọng của kiểm toán. Vì vậy, hoạt động kiểm toán nội bộ được tập trung nguồn lực để thực hiện kiểm toán đối với những lĩnh vực có rủi ro cao trong ngân hàng, nên vừa nâng cao khả năng phát hiện các sai phạm, tồn tại để đưa ra các kiến nghị xử lý, vừa giảm được các chi phí kiểm toán nội bộ (do không thực hiện kiểm toán dàn trải), điều này là cơ sở để đảm bảo hiệu quả hoạt động kiểm toán nội bộ.