Đấu thầu qua mạng là một trong những điểm rất mới trong luật đấu thầu 2005, là cho phép tổ chức “ đấu thầu qua mạng”. Đấu thầu qua mạng được thực hiện trực tuyến thông qua hệ thống mạng. Việc đăng tải thông báo mời thầu, phát hành hồ sơ mời thầu, nộp hồ sơ dự thầu, đánh giá hồ sơ dự thầu, thông báo kết quả đấu thầu được thực hiện trên hệ thống mạng quốc gia do cơ quan quản lý nhà nước về đấu thầu xây dựng và thống nhất quản lý.
Đây là một trong những giải pháp mang tính đột phá của nhà nước ta trong lĩnh vực đấu thầu. Áp dụng phương thức đấu thầu qua mạng có thể sẽ cho phép giảm thiểu thủ tục giấy tờ trong đấu thầu, tiết kiệm được chi phí và thời gian chuẩn bị hồ sơ của nhà thầu. Đấu thầu qua mạng có những ưu điểm sau:
Thứ nhất, nâng cao được trình độ ứng dụng khoa học kỹ thuật cho đội ngũ những người tham gia chấm thầu và cho đội ngũ nhà thầu. Áp dụng phương thức đấu thầu qua mạng sẽ tiết kiệm được những chi phí thủ tục, giấy tờ, hành chính.
Thứ hai, bản thân chủ đầu tư thông qua tổ chức đấu thầu qua mạng nâng cao trình độ tổ chức đấu thầu quốc tế. Xã hội càng phát triển, hội nhập càng tăng. Việt Nam gia nhập tổ chức thương mại quốc tế WTO càng đòi hỏi năng lực tổ chức đấu thầu quốc tế của đội ngũ chuyên gia đấu thầu áp dụng phương thức đấu thầu qua mạng sẽ buộc đội ngũ này phải tự nâng cao năng lực của bản thân mời đáp ứng yêu cầu ngày càng cao của xã hội.
Thứ ba, đấu thầu qua mạng sẽ cho phép giảm thiểu được sự xa cách về mặt địa lý và do đó khuyến khích sự tham gia chuyên gia chấm thầu không tập trung, thì khoảng cách về mặt địa lỹ đều được khắc phục.
Mặc dù đấu thầu quốc tế mua sắm hàng hóa qua mạng có một số ưu điểm đã, đấu thầu qua mạng cũng đòi hỏi phải giải quyết một số khó khăn, và khả năng có thể xẩy ra các tiêu cực mới trong đấu thầu sau đây:
Thứ nhất, hệ thống cơ sở hạ tần thông tin liên lạc, đặc biệt là hệ thống mạng thông tin cần phải được nâng cấp đảm bảo việc truyền tin an toàn, tốc độ. .
Thứ hai, một số hiện tượng tiêu cực có nguy cơ phát sinh như thiếu trung thực khi nhận tin của một bộ phận cán bộ khi họ có ý tránh đối đầu cho nhà thầu họ muốn thắng thầu, hiện tượng thông đồng móc ngoặc qua việc sửa chữa, thêm bớt và xóa bỏ thông tin giao nộp.
Thứ ba, trình độ đội ngũ cán bộ chưa kịp thích ứng với mô hình đấu thầu mới.
Việt Nam đã ra nhập tổ chức WTO, xu hướng toàn cầu hóa, để bắt kịp với thời đại đòi hỏi TCT nói riêng, mỗi doanh nghiệp, cả bên mời thầu và bên nhà thầu tham gia phải tích cực học hỏi, sẵn sàng hội nhập với xu thế toàn cầu, học tập phương pháp đấu thầu qua mạng mới. Hiện nay, cũng như các tổ chức mời thầu trong nước, TCT chưa thực hiện công tác đấu thầu qua mạng một cách phổ biến mà mới chỉ là thử nghiệm một số gói thầu. Công tác đấu thầu sử dụng mạng thông tin mới dừng lại ở bước mời thầu, thông báo kết quả xét thầu trên hệ thống mạng thông tin quốc gia. Để sẵn sàng thực hiện phương pháp, bản thân TCT cần chuẩn bị sẵn sàng về các điều kiện vật chất, nhân sự đấu thầu.