Trước trọng trách và nhiệm vụ bảo vệ bí mật và an toàn thông tin phục vụ sự nghiệp công nghiệp hóa, hiện đại hóa đất nước, củng cố quốc phòng an ninh, mở rộng quan hệ hợp tác quốc tế trong điều kiện những thế lực thù địch trong và ngoài nước không từ bỏ âm mưu chống phá Cách mạng nước ta trong mọi lĩnh vực; sự phát triển mạnh mẽ của khoa học công nghệ; sự đa dạng của phương tiện thông tin truyền thông; lượng thông tin lãnh đạo, chỉ đạo quản lý của Đảng và Nhà nước ngày càng nhiều, đặc biệt là trong bối cảnh đại dịch Covid 19 vô cùng phức tạp cũng gây khó khăn và ảnh hưởng rất lớn trong các công tác quản lý kinh tế cũng như phát huy vai trò trước những thế lực thù địch có âm mưu chống phá Nhà nước nói chung. Đại dịch Covid 19 không những làm ảnh hưởng đến chính trị của quốc gia nói chung, nó còn gây nên những ảnh hưởng rất lớn đến nền kinh tế trong đó tại Ban Cơ yếu Chính phủ cũng bị ảnh hưởng không hề nhỏ như làm gián đoạn các nhiệm vụ đang thực hiện dang dở dẫn đến nhiều nhiệm vụ không đảm bảo hoàn thành đúng tiến độ thậm chí có nhiều nhiệm vụ không thể thực hiện được. Điều này gây nên những hậu quả như không chi hết ngân sách, không thực hiện đúng tiến độ làm ảnh hưởng đến việc quyết toán trong kỳ báo cáo.
Bước vào giai đoạn mới, Ngành Cơ yếu Việt Nam trước yêu cầu cao của Đảng và Nhà nước về phục vụ nền Kinh tế - Xã hội về bảo mật an toàn thông tin vừa có nhiều thuận lợi cơ bản, vừa có những khó khăn lớn đan xen đòi hỏi Ngành Cơ yếu phải khắc phục đồng thời vẫn phát huy được nhiệm vụ.