Trong những năm qua, công tác thanh tra, kiểm tra và đảm bảo an toàn cấp nước của Thanh Hoá triển khai chưa tốt đã gây không ít khó khăn cho hoạt động cấp nước. Công tác thanh tra cấp nước đô thị chưa có hệ thống riêng, mặc dù theo luật quy định do thanh tra chuyên ngành xây dựng đảm trách, do vậy không cụ thể hoá được kế hoạch kiểm tra, biện pháp kiểm tra, chế tài xử lý. Mặc dù nội dung của việc thanh tra kiểm tra chuyên ngành cấp nước là rõ ràng, quy định các hành vi bị cấm có liên quan đến nước. Tuy nhiên,
hầu như thanh tra ngành xây dựng chỉ xử lý khi Công ty Cấp nước Thanh Hoá phát hiện các vụ vi phạm có liên quan đến hoạt động của chính công ty, như phá vỡ đường ống nước (do xây dựng công trình, nhà cửa...), trộm cắp nước. Còn đối với vi phạm các quy định về bảo vệ nguồn nước ít thấy bị thanh tra phát hiện xử lý. Chính vì lẽ đó, nguồn nước ngầm bị khoan, thăm dò, khai thác nước rất tuỳ tiện. Về nước mặt, các dòng sông, hồ đập ngày càng ô nhiễm tăng nhanh theo tốc độ tăng của công nghiệp hoá và đô thị hoá; ông Nguyễn Văn Mạnh, Chủ tịch kiêm Tổng Giám đốc Công ty cho biết, nguồn nước thô cấp cho nhà máy nước Hàm Rồng được lấy từ sông Chu đang bị ô nhiễm nặng. Nước có mầu nâu và thối không thể xử lý được nước sạch, năm 2005 nhà máy đã phải dừng sản xuất tới 7 lần vì lý do nêu trên. Công ty đã có công văn số 39 đề nghị UBND tỉnh và Thanh tra ngành có biện pháp khẩn cấp bắt buộc 2 nhà máy giấy Mục Sơn, Lam Sơn xử lý dứt điểm nước thải trước khi đưa ra sông Chu, nhưng vụ việc vẫn chưa được giải quyết là một minh chứng.
Đối với hoạt động cấp nước đô thị thì tài nguyên nước là yếu tố quan trọng đầu tiên, vì nó là đầu vào là nguyên liệu chính của hoạt động cấp nước. Việc bảo vệ nguồn nước, bảo vệ công trình cấp nước, tổ chức phát triển dịch vụ cấp nước là trách nhiệm của cơ quan quản lý nhà nước, của doanh nghiệp và của cộng đồng. UBND tỉnh Thanh Hoá cần chỉ đạo cơ quan chức năng, tăng cường hiệu lực thanh tra, kiểm tra, nghiêm khắc xử lý các hành vi vi phạm, đặc biệt gây ô nhiễm nguồn nước, một tài nguyên rất giá trị.