Cơ sở câu trúc cụa acid nucleic là các chuoêi polynucleotide câu táo từ nhieău đơn vị (mono)nucleotide. Trong những chuoêi này các mononucleotide nôi với nhau baỉng các lieđn kêt 3'-5'-phosphodiester như mođ tạ trong hình 4.7. Các chuoêi polynucleotide thường chứa từ hàng chúc đên hàng traím gôc mononucleotide. Tuy nhieđn, cũng có những chuoêi polynucleotide ngaĩn, chứa khođng quá 10 gôc nucleotide và chúng được gĩi chung là oligonucleotide (bao goăm di-, tri-, tetra-, penta-,hexanucleotide v.v...).
Người ta phađn bieơt hai lối polynucleotide là polyribonucleotide - cơ sở câu trúc cụa ARN, và polydeoxy-ribonucleotide - cơ sở câu trúc cụa ADN. Trong hình IV.7A giới thieơu moơt đốn polynucleotide đeơ ta có theơ hình dung sự hình thành lieđn kêt 3'-5'- phosphodiester. Đeơ mođ tạ thành phaăn và traơt tự saĩp xêp cụa các gôc nucleotide trong những chuoêi polynucleotide ngaĩn, người ta thường dùng kieơu mođ hình đơn giạn như trình bày trong hình IV.7B. Kieơu mođ tạ này cho phép phađn bieơt hai thành phaăn trong lieđn kêt phosphodiester, tức lieđn kêt a nôi gôc phosphate với C-3' và lieđn kêt b nôi gôc phosphate với C-5', qua đó táo ra caău nôi 3'-5'-phosphodiester giữa hai nucleotide kê caơn. Vieơc phađn bieơt lieđn kêt a với lieđn kêt b có ý nghĩa rât quan trĩng do hai kieơu lieđn kêt này mang tính đaịc hieơu khác nhau đôi với các enzyme thụy phađn acid nucleic. Đôi với các chuoêi poly-nucleotide dài, khođng theơ sử dúng kieơu mođ tạ này vì sẽ rât coăng keănh, và người ta thường dùng kieơu mođ tạ baỉng dãy chữ cái A, G, C, U hoaịc T, tức chữ cái đaău tieđn cụa teđn tiêng Anh các base nitơ như trình bày qua ví dú trong hình IV.7C. Trong trường hợp đôi với ADN trước dãy chữ cái này, tức ở đaău taơn cùng 5’ cụa chuoêi polypeptide, viêt theđm chữ d (deoxy-), ví dú dpApGpTp...
Hình IV.7. Câu táo cụa polynucleotide