III. Số doanh nghiệp có sai phạm về giá chuyển nhượng
Về lực lượng thanh tra
- Lực lượng cán bộ thanh tra, kiểm tra thuế vẫn chiếm tỷ lệ thấp (19,98%), đặc biệt là lực lượng thanh tra chuyên trách mới chiếm khoảng 2,69% tổng số cán bộ công chức trong ngành; trong khi đó số lượng doanh nghiệp tăng quá nhanh - nếu năm 2005 cả nước có 112.950 doanh nghiệp, thì đến đầu năm 2010 khoảng 450.000 doanh nghiệp và dự kiến đến cuối năm 2010 khoảng 500.000 doanh nghiệp chưa kế đến hơn 10 triệu người đã được cấp mã số thuế thu nhập cá nhân. Số NNT có quy mô hoạt động đa ngành, đa lĩnh vực ngày càng tăng đã tạo áp lức không nhỏ đối với ngành thuế và hoạt động thanh tra thuế.
lại là trung học. Ở các Chi cục Thuế thì có tới 60 % là trung học. Ở tất cả các cấp cán bộ thuế còn yếu về kỹ năng và nghiệp vụ thanh tra, kiểm tra và về khả năng sử dụng các thiết bị tin học; không có trình độ ngoại ngữ để thanh tra, kiểm tra các doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài. Thậm chí một số cán bộ thanh tra, kiểm tra ở cơ sở còn chưa nắm vững các chính sách thuế, chưa thành thạo về kế toán doanh nghiệp, phân tích đánh giá tài chính doanh nghiệp để có điều kiện phát hiện các gian lận về thuế. Nghiêm trọng hơn là một số cán bộ thanh tra, kiểm tra có biểu hiện vụ lợi, ý thức và trách nhiệm pháp luật thấp, lợi dụng công tác thanh tra, kiểm tra để gây phiền hà, sách nhiểu NNT.
Tính liên kết hệ thống của tổ chức thanh tra, kiểm tra toàn ngành (từ Tổng cục - Cục Thuế - Chi cục Thuế) chưa chặt chẽ. Vai trò của Thanh tra Tổng cục trong công tác chỉ đạo, hướng dẫn, hỗ trợ hoạt động thanh tra, kiểm tra toàn ngành còn hạn chế. Cơ cấu tổ chức trong nội bộ các đơn vị thanh tra, kiểm tra (Thanh tra Tổng cục và các phòng thanh tra, kiểm tra Cục Thuế) vẫn chưa hợp lý với nội dung và tính chất công việc của hoạt động thanh tra, kiểm tra thuế như: chưa có bộ phận chịu trách nhiệm về thu thập và xử lý thông tin, dữ liệu; bộ phận thẩm định biên bản của các đoàn thanh tra, kiểm tra; bộ phận rà soát lại tất cả hồ sơ của đoàn thanh tra, kiểm tra; bộ phận tổng kết, đúc rút phổ biến về kinh nghiệm, kiến nghị bổ sung sửa đổi chính sách, quy trình, thủ tục; bộ phận theo dõi các doanh nghiệp thực hiện quyết định xử lý sau thanh tra, kiểm tra thuế;...