Trong thủ tục hải quan đối với hàng hóa GC xuất khẩu, cơ quan hải quan có thể ứng dụng các phương tiện kỹ thuật hiện đại để thông quan hàng hóa một cách
nhanh chóng, giúp cho các doanh nghiệp giảm bớt các chi phí về thời gian, chi phí về lưu kho, lưu bãi hàng hóa...thúc đẩy hoạt động GC phát triển. Điều đó đòi hỏi cơ quan hải quan phải nâng cao năng lực làm việc, trau dồi kiến thức về chuyên môn nghiệp vụ, pháp luật, khoa học kỹ thuật, có như vậy mới giúp cho hoạt động xuất nhập khẩu nói chung và hoạt động GC xuất khẩu được nhanh chóng, giúp cho doanh nghiệp giảm bớt chi phí về thời gian, chi phí về lưu kho, lưu bãi hàng hóa. Năng lực của cơ quan quản lý và trang thiết bị phục vụ công tác quản lý là hai yếu tố có tác động rất lớn đến công tác quản lý hải quan đối với hoạt động gia công quốc tế. Nếu trình độ của cơ quan quản lý yếu kém, trang thiết bị phục vụ công tác chuyên môn lạc hậu hoặc không đủ sẽ dẫn đến việc doanh nghiệp lợi dụng chính sách ưu đãi, gây mất công bằng trong hoạt động sản xuất kinh doanh, hoặc làm mất nhiều thời gian, chi phí cho thủ tục liên quan đến hoạt động gia công quốc tế. Năng lực của cơ quan quản lý thể hiện ở trình độ chuyên môn nghiệp vụ, khả năng tuyên truyền, hỗ trợ, cung cấp thông tin, đạo đức nghề nghiệp của người cán bộ; khả năng áp dụng các văn bản quy phạm pháp luật; khả năng ứng dụng công nghệ thông tin, khoa học kỹ thuật vào công việc.