Tần suất xuất hiện của các alen ở kiểu genIC

Một phần của tài liệu (LUẬN văn THẠC sĩ) nghiên cứu tính đa hình di truyền của ký sinh trùng sốt rét và tính kháng thuốc sốt rét của plasmodium falciparum tại một số tỉnh biên giới thuộc khu vực bắc trường sơn, việt nam (Trang 96 - 99)

Phân tích 162 mẫu bệnh nhân có 117 mẫu bệnh nhân nhiễm kiểu gen IC (Bảng 3.11). Trong đó phát hiện có 9 mẫu nhiễm 2 alen khác nhau. Tổng số lần xuất hiện của các alen là 126 lần. Kết quả xác định số l-ợng và tần suất của từng alen đ-ợc trình bày ở Bảng 3.13.

Bảng 3.13. Tần suất xuất hiện của các alen ở kiểu gen IC Kiểu gen IC Kiểu gen IC STT Alen Kích th-ớc (bp) Số l-ợng Tần suất (%) 1 5 435 2 1,59 2 6 447 5 3,97 3 7 459 6 4,76 4 8 471 8 6,35 5 9 483 7 5,56 6 10 495 13 11,11 7 11 507 32 25,40 8 12 519 20 15,87 9 13 531 11 8,73 10 14 543 9 7,14 11 15 555 7 5,56 12 16 567 3 2,38 13 17 579 2 1,59 Tổng 126 100%

Bảng 3.13 cho thấy ở kiểu gen IC xác định đ-ợc 13 alen khác nhau bắt đầu từ alen 5 (5 đoạn lặp lại 12 nucleotide) đến alen 17. Trong đó 3 alen 10, 11 và 12 là phổ biến nhất. Alen 11 xuất hiện nhiều nhất chiếm tỷ lệ 25,40%, các alen 1 và 13 có tần suất xuất hiện thấp nhất (1,59%). Biểu đồ phân bố tần suất của các alen ở kiểu gen IC đ-ợc trình bày ở Hình 3.14.

1,59 3,97 4,76 6,35 5,56 11,11 25,40 15,87 8,73 7,14 5,56 2,38 1,59 0 5 10 15 20 25 30 T ỷ l ệ % 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 Alen

Hình 3.14. Biểu đồ tần suất xuất hiện của các alen ở kiểu gen IC

Kết quả điện di sản phẩm PCR của một số mẫu máu bệnh nhân nhiễm kiểu gen IC đ-ợc thể hiện ở Hình 3.15.

Hình 3.15. ảnh điện di một số bệnh nhân nhiễm kiểu gen IC

L : Thang chuẩn 50 bp

7G8: chứng dương (kiểu gen IC) (-): chứng âm

Mẫu T1, 4, 8, 15, 27, 28, 31,36, 48: Các bệnh nhân nhiễm kiểu gen IC

700 bp

400 bp

Kết quả phân tích 162 mẫu máu bệnh nhân nhiễm P. falciparum theo

locus msp2 đã xác định tổng số lần xuất hiện các alen ở cả 2 kiểu gen FC và

IC là 216 lần. Giá trị MOI phát hiện đ-ợc locus msp2 là 1,33 (216 lần/162

mẫu).

ở locus msp2, quần thể P. falciparum tại khu vực Bắc Tr-ờng Sơn, Việt Nam có mặt đồng thời cả 2 kiểu gen FC và IC. Trong đó kiểu gen FC chiếm tỷ lệ là 41,79% và kiểu gen IC chiếm tỷ lệ 58,21%. Tỷ lệ bệnh nhân nhiễm phối hợp 2 kiểu gen là 24,69%. Tổng số đã phát hiện đ-ợc 23 alen gồm có 10 alen ở kiểu gen FC và 13 alen ở kiểu gen IC. Giá trị MOI ở locus msp2 là 1,33.

Số l-ợng alen phát hiện đ-ợc ở locus msp2 có sự t-ơng đồng với kết quả nghiên cứu đa hình di truyền quần thể ở một số n-ớc nh- tại Ca-mơ-run phát hiện 23 alen [70], Mi-an-ma phát hiện 22 alen [107]. Tỷ lệ nhiễm phối hợp kiểu gen và giá trị MOI phát hiện đ-ợc của quần thể P. falciparum ở khu vực Bắc Tr-ờng Sơn, Việt Nam cũng t-ơng đồng với kết quả nghiên cứu tại một số

quốc gia có mức độ lan truyền sốt rét trung bình nh- tại ấn Độ [104], Pa-ki- xtan [98], Ma-lai-xia [65] nh-ng thấp hơn nhiều so với các quốc gia có mức độ lan truyền sốt rét cao nh- tại Ga-bông với tỷ lệ nhiễm phối hợp kiểu gen > 90% số bệnh nhân, giá trị MOI > 4,0 [66]; tại Mi-an-ma với tỷ lệ nhiễm phối hợp kiểu gen 68,3% [107].

Msp2 là locus biểu hiện tính đa hình cao, đ-ợc sử dụng nh- là dấu

chuẩn phân tử trong xác định mức độ nhiễm phối hợp kiểu gen, nhiễm đa alen và phân biệt bệnh nhân tái phát hay nhiễm mới sau khi áp dụng một phác đồ điều trị thuốc đối với bệnh nhân [11, 121].

3.2.3. Tính đa hình di truyền của P. falciparum theo locus glurp

Kiểu gen của P. falciparum theo locus glurp thể hiện tính đa hình di

truyền dựa trên số l-ợng lặp lại của đoạn trình tự lặp lại chứa 57 nucleotide. Trên một mẫu bệnh nhân, ở locus glurp có thể mang nhiều alen khác nhau.

Kết quả phân tích 162 mẫu bệnh nhân nhiễm P. falciparum ở locus này phát hiện đ-ợc 193 lần xuất hiện các alen có kích th-ớc từ 584 bp đến 1040 bp, giá trị MOI xác định đ-ợc ở locus glurp là 1,19.

Số l-ợng và tần suất xuất hiện của các alen theo locus glurp đ-ợc trình bày ở Bảng 3.14.

Một phần của tài liệu (LUẬN văn THẠC sĩ) nghiên cứu tính đa hình di truyền của ký sinh trùng sốt rét và tính kháng thuốc sốt rét của plasmodium falciparum tại một số tỉnh biên giới thuộc khu vực bắc trường sơn, việt nam (Trang 96 - 99)

Tải bản đầy đủ (PDF)

(160 trang)