Cơng thức tính các chỉ số và phân tích số liệu nghiên cứu

Một phần của tài liệu (LUẬN văn THẠC sĩ) nghiên cứu tính đa hình di truyền của ký sinh trùng sốt rét và tính kháng thuốc sốt rét của plasmodium falciparum tại một số tỉnh biên giới thuộc khu vực bắc trường sơn, việt nam (Trang 72 - 75)

2.4. Ph-ơng pháp nghiên cứu

2.4.5. Cơng thức tính các chỉ số và phân tích số liệu nghiên cứu

2.4.5.1. Cơng thức tính các chỉ số

 Các chỉ số về thành phần và cơ cấu loài KSTSR Số ng-ời mang KSTSR

+ Tỷ lệ nhiễm KSTSR(%) = ------------------------------- x 100

Tổng số ng-ời điều tra

Số l-ợng xuất hiện của một loài + Tỷ lệ cơ cấu loài KSTSR (%) = ------------------------------------- x 100

Tổng số KST đ-ợc phát hiện

 Các chỉ số mô tả đặc điểm kiểu gen của P. falciparum và P. vivax

Trong tất cả các bản điện di đều sử dụng thang đo phân tử (ladder) để xác định kích th-ớc sản phẩm PCR thu đ-ợc. Dựa vào thang đo này và phần mềm Gene labwork 4.0 của hệ thống chụp ảnh kỹ thuật số Bioimaging systems SDS - 8000 để tính đ-ợc kích th-ớc của sản phẩm PCR. Dựa vào vị trí bắt cặp của mồi với từng kiểu gen trong mỗi locus gen chúng tôi đ-a ra cơng thức tính đoạn lặp lại nh- sau:

Đối với kiểu gen K1:

MPCR = 31 + 9 x n + 66  n = (MPCR - 97): 9 Đối với kiểu gen MAD20:

MPCR = 34 + 9 x n + 36  n = (MPCR - 70): 9 Đối với kiểu gen FC:

MPCR = 150 + 36 x n + 34  n = (MPCR - 184): 36 Đối với kiểu gen IC:

MPCR = 48 + 12 x n + 327 n = (MPCR - 375): 12 Đối với alen của locus glurp:

MPCR =178 + 57 x n + 119  n = (MPCR - 297): 57 Trong đó MPCR: kích th-ớc của sản phẩm PCR n: số đoạn lặp lại. - Các chỉ số phân tích kiểu gen của P. falciparum và P. vivax

Số l-ợng của một kiểu gen + Tỷ lệ kiểu gen (%) = ---------------------------- x 100 Tổng số các kiểu gen

Số l-ợng của một alen

+ Tần suất của alen (%) = ------------------------------- x100

Tổng số l-ợng các alen

Tổng số l-ợng các alen + Giá trị nhiễm đa alen (MOI) = ---------------------------

Tổng số mẫu phân tích

 Chỉ số mô tả đặc điểm KSTSR mang gen đột biến kháng thuốc

Số l-ợng KST mang đột biến kháng + Tỷ lệ KSTSR kháng thuốc (%) = ----------------------------------------- x 100

Tổng số lần xuất hiện của KST

2.4.5.2. Xử lý số liệu nghiên cứu

Các số liệu nghiên cứu đ-ợc xử lý với ch-ơng trình thống kê sinh học EPI – INFO 6.0, Excel. Phần mềm xử lý số liệu Gene labwork 4.0 của hệ thống chụp và phân tích ảnh kỹ thuật số Bioimaging systems SDS - 8000.

Một phần của tài liệu (LUẬN văn THẠC sĩ) nghiên cứu tính đa hình di truyền của ký sinh trùng sốt rét và tính kháng thuốc sốt rét của plasmodium falciparum tại một số tỉnh biên giới thuộc khu vực bắc trường sơn, việt nam (Trang 72 - 75)

Tải bản đầy đủ (PDF)

(160 trang)