Vật liệu nghiên cứu

Một phần của tài liệu (LUẬN văn THẠC sĩ) nghiên cứu tính đa hình di truyền của ký sinh trùng sốt rét và tính kháng thuốc sốt rét của plasmodium falciparum tại một số tỉnh biên giới thuộc khu vực bắc trường sơn, việt nam (Trang 56 - 58)

2.3.1. Dụng cụ và hóa chất cho kỹ thuật xét nghiệm lam máu

+ Kính hiển vi, lam kính, kim chích máu, giá để lam, bơng + Dung dịch giemsa mẹ, dung dịch đệm, n-ớc cất, cồn 90o và 70o + Giấy thấm Whatman 3MM (để thu thập mẫu máu)

2.3.2. Thiết bị và hóa chất tách chiết ADN

+Tủ lạnh - 40C, -200C bảo quản mẫu và hóa chất

+ Các bộ micropipet (hãng Gilson – Pháp, Eppendorf - Đức)

+ Máy ly tâm tốc độ cao (Centrifuge 5415R - hãng Eppendorf - Đức) + Tủ ấm (hãng Menmert – Thổ Nhĩ Kỳ)

+ Máy lắc, máy khuấy từ Rotolab (hãng OSI, Pháp) + Cân phân tích kỹ thuật (hãng Sartorius - Đức) + Máy đo pH (HM-16S của hãng TOA, Nhật Bản)

+ ống Eppendorf 1,5 ml (hãng Corning -Mỹ, Watson-Nhật)

+ Đầu típ 1ml, 200l, 20l và 10l (Corning, Thermoscientific -Mỹ) + PBS; Saponin; Chelex resin 100, Ethanol... (hãng Sigma, Takara) + Bộ kít tách ADN (QIAamp DNA blood mini KIT - QIAGEN -Mỹ).

2.3.3. Thiết bị, dụng cụ và hóa chất để tiến hành phản ứng PCR

+ Máy PCR (AB 9700 hãng Applied Biosystems, Eppendorf Đức). + Các bộ micropipet (hãng Gilson – Pháp, Eppendorf-Đức)

+ Máy lắc Rotolab (hãng OSI- Pháp)

+ Tube PCR 0,2ml (hãng Corning, Thermoscientific- Mỹ)

+ Đầu típ 1ml, 200l, 20l và 10l (Corning, Thermoscientific -Mỹ) + Các cặp mồi để chẩn đốn, phân biệt 4 lồi KSTSR P. falciparum, P.

vivax, P. malariae, P. ovale.

+ Các cặp mồi xác định kiểu gen của P. falciparum ở locus msp1, msp2 và glurp.

+ Các cặp mồi xác định kiểu gen của P. vivax ở locus Pvcs và Pvmsp1. + Các cặp mồi xác định đột biến của P. falciparum kháng với một số

loại thuốc sốt rét.

Các mồi đ-ợc đặt tổng hợp từ hãng Geneworks - úc; Sigma, Invitrogen- Mỹ, Takara - Nhật. (Trình tự các cặp mồi đ-ợc trình bày ở phần sau) + dNTPs ( dATP, dCTP, dGTP, dTTP) (hãng Fermentas - Đức)

+ Taq DNA- polymerase (Viện Sốt rét - KST - CTTƯ sản xuất)

+ 10 X PCR buffers, MgCl2 25 mM (hãng Fermentas - Đức) + Các enzym giới hạn AluI và BstNI (hãng Fermentas)

+ N-ớc khử ion (Viện Sốt rét - KST - CTTƯ sản xuất bằng hệ thống EASYpure II- hãng Thermoscientific- Đức)

+ Chứng d-ơng là các đơn dòng chuẩn nh-: K1, 3D7, D10, 7G8, W2, T96 (Nguồn từ Viện nghiên cứu Y học nhiệt đới, Tr-ờng đại học Nagasaki, Nhật Bản và Khoa Y học nhiệt đới, Tr-ờng đại học Mahidol, Thái Lan)

2.3.4. Thiết bị, dụng cụ và hóa chất cho điện di phân tích kết quả PCR

+ Lị vi sóng

+ Bộ điện di (Mulpid-one- Nhật Bản, Apelex-Pháp) + Bộ micropipet (hãng Gilson), đèn soi gel (đèn UV)

+ Hệ thống chụp và phân tích ảnh Bioimaging systems SDS – 8000 + Máy in nhiệt Mitsubishi, giấy in nhiệt (Nhật)

+ Dung dịch đệm điện di TBE (1X, 10X)- Invitrogen-Mỹ + Agarose (TopVisionTM LE GQ, hãng Fermentas)

+ Dung dịch ethidium bromide 10mg/ml (hãng Sigma)

+ Các loại thang đo kích th-ớc phân tử ADN nh-: GenrulerTM100bp, 1kb, 50bp DNA ladder, Marker BR322 DNA/BsuRI, phiX174 DNA/BsuRI (HaeIII) Marker (hãng Fermentas)

Một phần của tài liệu (LUẬN văn THẠC sĩ) nghiên cứu tính đa hình di truyền của ký sinh trùng sốt rét và tính kháng thuốc sốt rét của plasmodium falciparum tại một số tỉnh biên giới thuộc khu vực bắc trường sơn, việt nam (Trang 56 - 58)

Tải bản đầy đủ (PDF)

(160 trang)