3.2.1. Tính đa hình di truyền của P. falciparum theo locus msp1
3.2.1.1. Đặc điểm phân bố kiểu gen của P. falciparum theo locus msp1
Sử dụng kỹ thuật PCR với các cặp mồi đặc hiệu phân tích 162 mẫu bệnh nhân nhiễm P. falciparum theo locus msp1 để xác định tỷ lệ phân bố của 3
kiểu gen K1, MAD20 và RO33 trong quần thể. ở locus msp1, một mẫu bệnh nhân có thể mang từ 1 đến 3 kiểu gen khác nhau và trong từng kiểu gen cũng có thể nhiễm nhiều alen khác nhau. Kết quả xác định số l-ợng và tỷ lệ của các kiểu gen trong quần thể P. falciparum ở khu vực Bắc Tr-ờng Sơn đ-ợc trình
bày ở Bảng 3.7 và Hình 3.5.
Bảng 3.7. Tỷ lệ phân bố các kiểu gen của P. falciparum theo locus msp1 Locus Locus Địa điểm Locus msp1 Tổng K1 MAD20 RO33 n (%) N (%) n (%) Quảng Bình (n=67) 29 34,52 39 46,43 16 19,05 84 Quảng Trị (n=81) 35 32,11 56 51,38 18 16,58 109
Thừa Thiên Huế (n=14) 6 37,50 9 56,25 1 6,25 16
Tính chung 3 tỉnh (162) 70 33,49 104 49,76 35 16,75 209
Kết quả phân tích 162 mẫu bệnh nhân nhiễm KSTSR P. falciparum đã
phát hiện có mặt cả 3 kiểu gen K1, MAD20 và RO33. Tổng số lần xuất hiện của cả 3 kiểu gen trong 162 mẫu là 209 lần. Trong đó kiểu gen K1 chiếm 33,49%, kiểu gen MAD20 chiếm tỷ lệ 49,76% và kiểu gen RO33 chiếm tỷ lệ là 16,75%. Tỷ lệ giữa 3 kiểu gen trong quần thể có sự khác biệt có ý nghĩa
thống kê với p < 0,05. Kiểu gen MAD20 phát hiện đ-ợc với tỷ lệ cao hơn so với các kiểu gen khác ở cả 3 tỉnh.
Locus msp1
49,76%
16,75%
33,49%
K1 MAD20 RO33
Hình 3.5. Biểu đồ biểu diễn sự phân bố các kiểu gen theo locus msp1
ở khu vực Bắc Tr-ờng Sơn, kết quả phân tích cũng cho thấy có nhiều mẫu bệnh nhân nhiễm phối hợp 2 hoặc cả 3 kiểu gen. Trong 162 mẫu bệnh nhân đ-ợc phân tích có 120 mẫu bệnh nhân nhiễm đơn một trong 3 kiểu gen chiếm tỷ lệ 74,07% và 42 mẫu nhiễm phối hợp 2 hoặc 3 kiểu gen chiếm tỷ lệ 25,93%. Trong đó có 05 mẫu nhiễm phối hợp cả 3 ba kiểu gen và 37 mẫu nhiễm phối hợp 2 kiểu gen. Kết quả phân tích tỷ lệ nhiễm đơn và nhiễm phối hợp các kiểu gen đ-ợc trình bày ở Bảng 3.8.
Bảng 3.8. Tỷ lệ mẫu nhiễm đơn và nhiễm phối hợp kiểu gen theo locus msp1 Kiểu nhiễm Locus msp1 Nhiễm đơn Nhiễm phối hợp K1 MAD20 RO33 Số l-ợng mẫu 36 65 19 42 Tỷ lệ % 22,22 40,12 11,73 25,93 Tổng 74,07% 25,93%
Sử dụng phần mềm Gene Labwork của hệ thống chụp ảnh kỹ thuật số Bioimaging system SDS-8000 để tính kích th-ớc phân tử sản phẩm PCR của các mẫu bệnh nhân trên ảnh điện di và xác định alen theo cơng thức tính đoạn lặp lại đ-ợc trình bày ở Ch-ơng 2. Kết quả thu đ-ợc nh- sau: