Nhiệm vụ quan trọng của nước ta trong giai đoạn 2016 - 2018 là tiến hành triển khai công tác cải cách, phát triển và hiện đại hóa trong bối cảnh đã chính thức gia nhập WTO, mở rộng các mối quan hệ song phương và đa phương, hội nhập sâu rộng và toàn diện vào các diễn đàn kinh tế thế giới nên các hoạt động XNK hàng hóa, phương tiện vận tải và hành khách XNC dự báo sẽ tăng lên nhanh chóng. Sản xuất trong nước sẽ phát triển với tốc độ cao nên vẫn cần tiếp tục NK thiết bị, máy móc và nguyên vật liệu. Kim ngạch hàng hóa XK tiếp tục gia tăng do đã chuẩn bị cơ sở sản xuất từ nhiều năm trước. Đầu tư nước ngoài tại Việt Nam được dự báo sẽ tiếp tục tăng với tốc độ cao.
Xu hướng XK, NK hàng hóa: Trong suốt thời kỳ mở cửa hội nhập của nền kinh tế VN cho tới nay, XNK đã trở thành một trong những động lực chủ yếu của tăng trưởng, góp phần ổn định kinh tế - xã hội như giải quyết việc làm, tăng thu nhập, xóa đói giảm nghèo...
Phương hướng đổi mới của Tổng cục Hải quan: Thực hiện ý kiến chỉ đạo của Lãnh đạo Bộ, ngành Hải quan đang gấp rút nghiên cứu, cải tiến thủ tục Hải quan phù hợp với yêu cầu cải cách hành chính, xây dựng chính sách minh bạch nhằm tạo thuận lợi cho hoạt động của DN và người dân, đặc biệt là hoàn thiện các văn bản để chuyển thông quan điện tử từ thí điểm sang chính thức, đảm bảo hết năm 2019, 100% số lượng tờ khai Hải quan cũng như kim ngạch XK, NK áp dụng thủ tục Hải quan điện tử.
Một nội dung quan trọng trong đó là Luật Quản lý thu thuế đang được xem xét, sửa đổi bổ sung. Khi luật này được hoàn thiện một loạt nghị định, thông tư về thủ tục Hải quan, chế độ kiểm tra, giám sát Hải quan sẽ được thay đổi. Những văn bản mới này sẽ hướng dẫn một số nội dung về thủ tục quản lý thu thuế thực hiện đồng thời trong quá trình làm thủ tục Hải quan, kiểm tra, giám sát Hải quan và KTSTQ. Thủ tục Hải quan, kiểm tra Hải quan, giám sát Hải quan, quản lý thu thuế
giá quá trình chấp hành pháp luật của người khai Hải quan, người nộp thuế để áp dụng phương pháp QLRR. Có ưu tiên và tạo thuận lợi đối với chủ hàng chấp hành tốt pháp luật về Hải quan, pháp luật thuế. Hàng hoá XNK của chủ hàng đã nhiều lần vi phạm pháp luật về Hải quan sẽ không được ưu tiên khi làm thủ tục Hải quan. Mục tiêu của các văn bản sau này là thu gọn đầu mối văn bản và thực hiện quản lý một cách thống nhất, xuyên suốt trong toàn bộ quá trình từ trước, trong và sau thông quan.
Với chương trình GTT01 ta có thể cập nhật được toàn bộ các nguồn thông tin, từ hàng hóa XK, NK, từ internet, sách báo, tạp chí, có thể đính kèm hình ảnh của hàng hóa XK, NK...; tự động truyền nhận dữ liệu giữa ba cấp: chi cục- cục- tổng cục; đặc biệt là có chứa danh mục hàng hóa XK, NK rủi ro cấp tổng cục và cấp cục. Hệ thống này đảm bảo sự tra cứu được thuận lợi, dễ xác định hàng hóa giống hệt, tương tự khi xác định giá tính thuế, tiết kiệm được thời gian.