Quá trình xử lý thông tin khi triển khai mô hình thủ tục hải quan điện tử
cũng diễn ra nhanh hơn so với thủ tục hải quan truyền thống, giúp thời gian
thông quan đối với các lô hàng giảm đi đáng kể, cụ thể là đối với các lô hàng thuộc luồng xanh, thời gian thông quan trung bình là 3-15 phút; đối với các lô hàng thuộc luồng vàng là 20-30 phút; đối với các lô hàng thuộc luồng đỏ thì phụ thuộc vào thời gian kiểm tra thực tế hàng hóa.
Bên cạnh đó, Hải quan đã áp dụng phương thức quản lý rủi ro để đánh giá độ tuân thủ và phân luồng hàng hóa dựa trên bộ tiêu chí quản lý rủi ro và hồsơ tuân thủ doanh nghiệp thay cho việc kiểm soát từng giao dịch.
Thủ tục hải quan điện tử cũng giảm đáng kể số lượng giấy tờ phải nộp cho cán bộ Hải quan, cụ thể là đối với các lô hàng thuộc luồng xanh, doanh nghiệp chỉ cần khai tờ khai hải quan còn các chứng từ khác lưu tại doanh nghiệp; đối với các lô hàng thuộc luồng vàng, doanh nghiệp cũng chỉ phải nộp các chứng từ khi có yêu cầu của cơ quan Hải quan (có thể là chứng từ giấy hoặc chứng từđiện tử).
Ngoài ra, nhờ có thủ tục hải quan điện tử, tỷ lệ kiểm tra hàng hóa cũng
giảm đi, chiếm khoảng 5%, trong đó chủ yếu là hàng đã qua sử dụng hoặc
47
dán tem, hàng có nghi ngờ về thuế suất và một số trường hợp kiểm tra xác
định xác suất ngẫu nhiên.