Ðiều kiện "thông quan" gây ra nhiều hiểu lầm. Do vậy, khi dẫn chiếu đến nghĩa vụ của người bán hoặc người mua cam kết thực hiện những nghĩa vụ liên quan đến việc đưa hàng qua hải quan nước xuất khẩu hoặc nhập khẩu thì rõ ràng là những nghĩa vụ này không chỉ bao gồm thuế hải quan và các chi phí khác mà còn bao gồm các hoạt động và thanh tóan mang tính chất hành chính khác có liên quan đến việc thông quan. Ngoài ra, một số nước cho rằng việc áp dụng các điều kiện đòi hỏi nghĩa vụ thông quan là không phù hợp với buôn bán nội bộ các nước EU. Hoặc các khu vực mậu dịch tự do khác nơi mà không có bất cứ nghĩa vụ gì liên quan đến trả thuế và không có hạn chế gì về xuất nhập khẩu. Ðể làm rõ tình hình, cụm từ "nếu có" được thêm vào trong A2, B2, A6, B6 của các điều kiện Incoterms tương ứng nhằm sử dụng chúng không một chút mập mờ tại những nơi không đòi hỏi thủ tục thông quan.
Thông thường bên cư trú trong nước làm thủ tục thông quan hàng hóa nếu cần hoặc ít nhất ai đó làm hộ anh ta. Do vậy, người xuất khẩu thường làm thông quan xuất khẩu còn người nhập khẩu làm thông quan nhập khẩu.
Incoterms 1990 quy định từ điều kiện EXW và FAS (người mua làm thông quan xuất khẩu) và DEQ "người bán làm thông quan nhập khẩu" nhưng trong Incoterms 2000, FAS và DEQ quy định nghĩa vụ thông quan hàng xuất khẩu cho người bán và thông quan nhập khẩu cho người mua trong khi EXW- nghĩa vụ người bán là tối thiểu - vẫn để nguyên không sửa đổi (người mua có nghĩa vụ thông quan xuất khẩu). Theo DDP người bán thỏa thuận một cách chi tiết theo đúng tên của điều kiện-Giao hàng đã nộp thuế- làm thủ tục nhập khẩu và trả bất cứ khoản thuế nào có liên quan.