Bảng 2.7 Số thuế được miễn và số thuế thu được qua các năm
2.3.2.2. Những tồn tại:
- Thiếu sự thống nhất các quy trình làm thủ tục hải quan đối với hàng hóa miễn thuế NK tạo TSCĐ của dự án đầu tư tại tất cả các Chi cục trên toàn quốc.
- Quy trình thủ tục hải quan đối với hàng hóa miễn thuế NK tạo TSCĐ của dự án đầu tư về cơ bản vẫn là một quy trình thủ công, mặc dù có ứng dụng công nghệ thông tin ở một số công đoạn như tiếp nhận tờ khai, quản lý rủi ro đối với hàng hóa xuất nhập khẩu nhưng còn thiếu đồng bộ và chưa đáp ứng được yêu cầu.
- Tỷ lệ khai báo hải quan điện tử của các DN NK máy móc, thiết bị tạo TSCĐ của dự án đầu tư phân bổ không đồng đều giữa các địa phương, có nơi tỷ lệ này rất thấp hoặc chưa thực hiện.
- Xảy ra tình trạng chồng chéo nghiệp vụ giữa bước 1 và bước 2.
- Tỷ lệ hàng thực kiểm còn lớn và kiểm hóa thủ công tạo ra các kẽ hở để công chức hải quan có thái độ nhũng nhiễu, gây phiền hà, gây khó khăn cho DN.
- Thời gian thông quan còn tương đối dài ở các khâu thông quan như xác nhận danh mục hàng hóa miễn thuế, tiếp nhận tờ khai, kiểm tra hồ sơ, kiểm tra thực tế hàng hóa.
- Việc xác định trị giá tính thuế đối với mặt hàng này còn mang nặng tính hình thức, đối phó. Chưa thực sự quan tâm đến công tác này, các DN có vốn ĐT
nước ngoài lợi dụng việc này khai tăng trị giá hàng hóa đầu tư để thông qua việc này thực hiện chuyển giá.
- Công tác phúc tập hồ sơ mặt hàng này chưa được chú trọng, không giúp ích được nhiều cho quy trình kiểm tra sau thông quan.
- Đa số máy móc, thiết bị tạo TSCĐ của dự án đầu tư đều thuộc đối tượng được miễn thuế. Tuy nhiên, việc xét miễn thuế vẫn thực hiện thủ công mang nặng tính chủ quan, tạo kẽ hở cho gian lận thương mại.
- Công chức hải quan gặp khó khăn rất lớn trong việc xác định sự đồng bộ, phù hợp của các thiết bị máy móc khi đã tháo rời để NK cả dây chuyền trong khâu kiểm tra thực tế hàng hoá đối với mặt hàng này.
- Quy trình thủ tục hải quan đối với hàng hóa miễn thuế NK tạo TSCĐ của dự án đầu tư chưa tách bạch được việc kiểm tra thực tế hàng hoá (luồng đỏ) đối với hàng hoá luồng xanh và luồng vàng.
- Bộ hồ sơ hải quan cần nộp của DN NK máy móc, thiết bị tạo TSCĐ của dự án đầu tư còn phức tạp.