Bản chất của nước thải sinh hoạt có chứa nhiều chất hữu cơ, chất rắn lơ lửng và các vi sinh vật,…. Nguồn nước này nếu không được xử lý tốt sẽ ảnh hưởng đến nguồn nước mặt hoặc nước ngầm.
Về mặt vệ sinh và sức khỏe, các chất bài tiết là phân và nước tiểu. Rất nhiều các bệnh truyền nhiễm lây lan qua phân và nước tiểu, từ người bệnh đến người khỏe mạnh. Lượng chất hữu cơ của phân và nước tiểu được đánh giá theo chỉ tiêu BOD5 và COD. Nước tiểu có BOD5 khoảng 8.6gO2/l, của phân khoảng 9.6gO2/100g. Như vậy, nếu lượng nước tiểu và phân của công nhân không xử lý sẽ gây ảnh hưởng đến môi trường đất và nước trong khu vực Dự án.
Có bốn nhóm gây bệnh điển hình từ chất bài tiết là vi rút, vi khuẩn, động vật nguyên sinh và giun sán. Hơn nữa các chất bài tiết còn là môi trường để các vi sinh vật gây bệnh phát triển như ruồi, muỗi, chuột, nhặng. Theo thống kê 1gram phân chứa khoảng 109 vi rút gây bệnh. Mặc dù chúng không có khả năng sinh sản bên ngoài động vật chủ nhưng chúng tồn tại lâu dài ở môi trường bên ngoài. Trong nước thải sinh hoạt chứa 105 con/l vi rút các loại. Vì vậy, nếu xả nước thải sinh hoạt một cách bừa bãi các loại vi rút này sẽ phát tán và truyền bệnh khi tiếp xúc với người và lây thành dịch bệnh. Các loại vi rút gây bệnh có trong phân có thể kể đến như:
Adenovirut, Pliovirut, Enchovirut, Coxsackie, Rota virut.
Ngoài ra, có nhiều loài động vật nguyên sinh có thể gây nhiễm trùng và gây bệnh cho người. Trong số này có nhiều loại sống trong hệ tiêu hóa của người và động vật, chúng gây bệnh tiêu chảy và lị. Ba loại động vật nguyên sinh thường gây bệnh cho con người bằng đường tiêu hóa là Giadai Lambia (Bệnh tiêu chảy), Balantidum Coli (Bệnh tiêu chảy, lị), Entamoeba hystolytica và Faciolopsis (apxe gan). Chỉ có trứng giun hoặc ấu trùng là thải theo phân.
Những phân tích ở trên cho thấy nước thải sinh hoạt và chất bài tiết có nhiều vi rút, vi khuẩn, giun sán gây bệnh cho người. Do đó, để tránh làm phát sinh và lây lan bệnh tật cần đưa nước thải sinh hoạt vào bể tử hoại trước khi thải ra môi trường.