Trong sỏi gồm cú 90% trọng lượng là tinh thể vụ cơ, cũn lại 5% là nước, 3% là protein, trong đú cú gluco- protein cú tờn là Tamm- Horsfall, ngoài ra là cỏc yếu tố vi lượng khỏc như citrat, kim loại kiềm, fluo…[44] .
Cỏc phương phỏp phõn tớch thành phần húa học của sỏi như: phương phỏp húa học, phổ Raman, nhiễu xạ tia X, nhiệt vi sai, kỹ thuật hạt nhõn, quang phổ hồng ngoại [96]. Ngoài ra cũn cú cỏc phương phỏp mới được sử dụng những năm đầu thế kỷ 21 như: phương phỏp laser màu xung (pulsed dye laser), phương phỏp phổ điện tử dạng chấm nhỏ (small- spot electron spectroscopy) [71].
+ Calcium oxalate: Chiếm 85% cỏc loại sỏi, dưới dạng cú 2 phõn tử nước và một phõn tử nước, màu vàng hoặc đen, sỏi cản quang, bề mặt xự xỡ và nhiều gai, sỏi rất rắn.
+ Calcium phosphate: Dưới dạng brushit hay apatit, màu trắng, cú nhiều lớp, cản quang, dễ vỡ khi tỏn.
+ Ammonium- magnesium- phosphate: Gặp khoảng 5- 15% cỏc loại sỏi, phỏt triển nhanh thành sỏi to, sỏi san hụ, màu trắng ngà. Sỏi do nhiễm khuẩn gõy nờn, do cỏc vi khuẩn gram õm sản xuất men ureasa, chủ yếu là Proteus, sau đú là Providentia, Klebsiella, Serratia, và Enterobacter. Chất ureasa chuyển ure trong nước tiểu thành kiềm gõy kết tủa sỏi amoni magie phosphate, nhu mụ thận bị phỏ huỷ nhanh chúng và việc điều trị gặp nhiều khú khăn.
+ Acid uric: Chiếm 6%, màu nõu, khụng cản quang, hay gặp ở nam giới, hay kết hợp với sỏi calcium oxalate, rất cứng.
+ Cystine: Chiếm 1- 2%, màu trắng ngà, thành phần hầu như chỉ cú cystine, đụi khi nú kết hợp với sỏi calcium phosphate, thường gặp ở người trẻ, sỏi cứng, ớt gặp ở Việt nam.
Trờn thực tế, cỏc thành phần này thường phối hợp với nhau để cấu tạo thành sỏi hỗn hợp. Dựa vào mức độ cản quang sỏi trờn phim, màu sắc sỏi cú thể tiờn lượng được mức độ rắn hay mềm của sỏi.