Xây dựng quy trình loop mediated isothermal amplification dựa trên gen cpn60 nhằm phát hiện streptococcus suis

[...]... quan hệ loài giữa các seroytpe S suis dựa trên trình tự gen cpn60 Tác giả chứng minh trình tự gen cpn60 giữa 35 serotype S suis có sự khác biệt nhiều hơn so với trình tự 16S rRNA Kết quả nghiên cứu này chứng minh gen cpn60 có khả năng phân biệt loài có mối quan hệ gần tốt hơn so với trình tự 16S rRNA Trình tự gen cpn60 giống nhau giữa các loài vi khuẩn là 70%, trong khi đó gen 16S rRNA là (91 93%), do... vi khuẩn gây bệnh Chính vì những lý do trên, chúng tôi đã thiết kế mồi dựa vào gen cpn60 để phát hiện S suis bằng phương pháp LAMP 1.5 Phương pháp Loop mediated isothermal amplification (LAMP) 1.5.1 Sơ lược về một số phương pháp chẩn đoán tác nhân gây bệnh Hiện nay, việc chẩn đoán và phát hiện tác nhân gây bệnh trong điều trị bệnh nhiễm thường được tiến hành dựa trên nền tảng của kỹ thuật nuôi cấy phân... nếu dựa vào gen 16S rRNA bằng phương pháp PCR [6], [65] Gần đây, A Dmitriev và cộng sự chứng minh phương pháp PCR dựa vào gen cpn60 khi phát hiện 3 tác nhân gây bệnh Streptococcus agalactiae, Streptococcus dysgalactiae và Streptococcus uberis có tính đặc hiệu cao [3] LUẬN VĂN THẠC SĨ SINH HỌC Trang 17 Từ đó có thể kết luận rằng gen cpn60 có tiềm năng ứng dụng trong quá trình chẩn đoán và phát hiện. .. quan hệ phát sinh loài giữa các seroptype S suis, tuy nhiên trình tự 16S rRNA giữa các serotype S suis không có sự khác biệt nhau vì thế việc xác định cây phát sinh loài không rõ ràng Gen cpn60 là một trong 7 gen giữ nhà (housekeeping gene) có độ bảo tồn cao ở S suis Tuy nhiên, các nghiên cứu khác dựa vào trình tự gen cpn60 có thể phân biệt những loài có mối quan hệ gần Enterococcus [49], Streptococcus. .. eukaryote Cpn60 được xác định một số vi khuẩn gây bệnh (S suis, Mycobac-terium tuberculosis, Myaobacterium leprae, Chlamydia trachomatis…) [32] Tuy nhiên, Mycoplasma pulmonis và Ureaplasma urealyticum không phát hiện thấy gen cpn60 [38] Nghiên cứu gần đây công bố phát hiện gen cpn60 ở vi khuẩn cổ và Methanosarcina [46] Ở hầu hết vi khuẩn, bộ gen chỉ có 1 copy cpn60 như S suis chứa 1 copy cpn60 , ngược... L pneumophila phát hiện gen cpn60 ở bề mặt tế bào, có vai trò gắn kết giữa vi khuẩn với tế bào chủ Điều này chứng minh được rằng protein CPN60 mang tính kháng nguyên ở các vi khuẩn gây bệnh Lewthwaite và cộng sự chứng minh gen cpn60 là yếu tố độc lực đối với tế bào vật chủ [52] 1.4.2.4 Tiềm năng gen cpn60 Trong nghiên cứu trước đây, Chatellier và cộng sự dựa vào trình tự gen 16S rRNA nhằm cung cấp... người và heo Năm 1983 lần đầu tiên phát hiện ra 9 serotype [75], sau đó năm 1991 tìm thấy đến serotype 28 [28] và cuối cùng đến năm 1995 phát hiện 6 serotype cuối 29 - 34 [37] Năm 2000, dựa vào trình tự 16S rRNA và gen cpn60 chứng minh serotype 32, 34 có mối quan hệ gần với Streptococcus orisratti Trong các serotype S suis, serotype 1 - 9 và 14 là những serotype hiện diện phổ biến ở heo nhiễm bệnh... nhiều copy cpn60 đặc biệt ở thực vật (cpn60 chứa trong ti thể và lục lạp) [38] , chẳng hạn Arabidopsis thaliana có tất cả 9 gen cpn60, trong đó 3 gen hiện diện trong ti thể, 2 tiểu đơn vị cpn60- α và 4 tiểu đơn vị cpn60- β ở lục lạp [38] LUẬN VĂN THẠC SĨ SINH HỌC Trang 15 1.4.2.3 Chức năng - CPN60 nằm bên trong tế bào chất, giữ vai trò gấp cuộn protein trong điều kiện bình thường lẫn stress nhằm bảo vệ... tiên phát hiện ra serotype 27, trong số 46 chủng S suis thì chỉ có 4 chủng được xác định serotype 27 [28] Một nghiên cứu khác năm 1996 Amass cùng cộng sự phát hiện serotype 27 chỉ chiếm (3.7%) trong số 54 mẫu thực địa [81] Bên cạnh đó, năm 1995 trong số 75 chủng S suis xác định 7 chủng là serotype 29 [37] Từ đó đến nay rất ít bài báo công bố phát hiện S suis serotype 29 ở heo nhiễm bệnh Tỉ lệ S suis. .. LIỆU Trang 1 1 Tổng quan 1.1 Đặc điểm chung S suis 1.1.1 Hình thái, phân loại và một số đặc điểm sinh học Theo Elliot 1966 và Kilper, Schleifer 1987, Streptococcus suis (S suis) được phân loại như sau: Giới: Bacteria Ngành: Firmicutes Lớp: Bacilli Bộ: Lactobacillales Họ: Streptococcaceae Giống: Streptococcus Loài: Streptococcus suis Streptococcus suis (S suis) là cầu khuẩn Gram dương, kỵ khí tùy nghi,