Tiềm năng gen cpn60

Một phần của tài liệu Xây dựng quy trình loop mediated isothermal amplification dựa trên gen cpn60 nhằm phát hiện streptococcus suis (Trang 28 - 29)

1. Tổng quan

1.4.2.4Tiềm năng gen cpn60

Trong nghiên cứu trước đây, Chatellier và cộng sự dựa vào trình tự gen 16S rRNA nhằm cung cấp thông tin về mối quan hệ phát sinh loài giữa các seroptype S. suis, tuy nhiên trình tự 16S rRNA giữa các serotype S. suis không có

sự khác biệt nhau vì thế việc xác định cây phát sinh loài không rõ ràng. Gen cpn60 là một trong 7 gen giữ nhà (housekeeping gene) có độ bảo tồn cao ở S. suis. Tuy

nhiên, các nghiên cứu khác dựa vào trình tự gen cpn60 có thể phân biệt những loài có mối quan hệ gần Enterococcus [49], Streptococcus [49], Staphylococcus [50].

Nguyên nhân này thúc đẩy Brousseaus và cộng sự tiến hành xác định mối quan hệ loài giữa các seroytpe S. suis dựa trên trình tự gen cpn60. Tác giả chứng minh

trình tự gen cpn60 giữa 35 serotype S. suis có sự khác biệt nhiều hơn so với trình tự 16S rRNA. Kết quả nghiên cứu này chứng minh gen cpn60 có khả năng phân

biệt loài có mối quan hệ gần tốt hơn so với trình tự 16S rRNA. Trình tự gen cpn60 giống nhau giữa các loài vi khuẩn là 70%, trong khi đó gen 16S rRNA là (91 - 93%), do đó có thể xảy ra trường hợp dương tính giả nếu dựa vào gen 16S rRNA bằng phương pháp PCR [6], [65].

Gần đây, A. Dmitriev và cộng sự chứng minh phương pháp PCR dựa vào gen

cpn60 khi phát hiện 3 tác nhân gây bệnh Streptococcus agalactiae, Streptococcus dysgalactiae và Streptococcus uberis có tính đặc hiệu cao [3].

Từ đó có thể kết luận rằng gen cpn60 có tiềm năng ứng dụng trong quá trình chẩn đoán và phát hiện các vi khuẩn gây bệnh. Chính vì những lý do trên, chúng tôi đã thiết kế mồi dựa vào gen cpn60 để phát hiện S. suis bằng phương pháp

LAMP.

Một phần của tài liệu Xây dựng quy trình loop mediated isothermal amplification dựa trên gen cpn60 nhằm phát hiện streptococcus suis (Trang 28 - 29)