Với vai trò hỗ trợ cung cấp thông tin tín dụng cho các ngân hàng, trung tâm tín dụng CIC thành lập năm 1999 nhưng trong quá trình hoạt động đã bộc lộ nhiều hạn chế:
Chất lượng thông tin còn chưa thật chính xác, có trường hợp thông tin dư nợ của CIC còn thấp hơn số thực tế do chưa kịp thời cập nhật từ các NHTM khác nhau.
Đối tượng được phép sử dụng thông tin tín dụng bị thu hẹp trong phạm vi ngành ngân hàng. Những doanh nghiệp đã có quan hệ tín dụng với NHTM mới được biết đến và có lịch sử tín dụng tại CIC, còn các doanh nghiệp mới thành lập hoặc chưa có quan hệ tín dụng với các NHTM thì không được lưu trữ thông tin trong trung tâm này. Đây là điểm gây bất lợi cho các doanh nghiệp khi muốn sử dụng dịch vụ bao thanh toán cho lần đầu tiên giao dịch với các ngân hàng.
Thông tin tổng hợp theo ngành, thành phần kinh tế chưa phong phú. Sản phẩm thông tin cung cấp cho ngân hàng chưa phong phú.
Nguồn nhân lực tại CIC còn thiếu về số lượng, yếu về trình độ chuyên môn. Ngoài CIC, hiện tại, ở Việt Nam đã có trung tâm tín dụng tư nhân đầu tiên là PCB được góp vốn bởi 11 NHTM (ACB, ABBank, VietinBank, BIDV, Đông Á, Techcombank, VCB, SCB, Sacombank, VIB và VPBank). Ngoài ra CRIF – hãng thông tin tín dụng của Italy – đã đạt thỏa thuận trở thành cổ đông lớn nhất của PCB với 20% vốn sở hữu. Cũng theo thỏa thuận này, CRIF sẽ chuyển giao toàn bộ hệ
thống kỹ thuật cho PCB. Trung tâm PCB chính thức cung cấp dịch vụ từ 07/2010 trong đó có các loại báo cáo tình hình vay nợ, tài sản thế chấp, lịch sử quan hệ tín dụng cho thể nhân và các doanh nghiệp vừa và nhỏ (Nhật Minh, 2010). Do mới đi vào hoạt động chưa lâu nên trung tâm này vẫn chưa phát huy hết năng lực và chưa cung cấp nhiều dịch vụ cho ngân hàng.
Trong nghiệp vụ factoring, các ngân hàng cần thẩm định hoạt động sản xuất kinh doanh của cả bên bán và bên mua. Vì vậy những thông tin chính xác và cập nhật nhất là rất cần thiết để các ngân hàng quyết định hạn mức bao thanh toán cho khách hàng. Những khuyết điểm của hệ thống thông tin tín dụng cộng với nguồn nhân lực chưa chuyên nghiệp tạo nên sự e ngại cho phía ngân hàng trong việc cung cấp đa dạng sản phẩm bao thanh toán. Điều này lý giải cho thực trạng phần lớn thị trường bao thanh toán Việt Nam rơi vào tay các Ngân hàng nước ngoài và Chi nhánh Ngân hàng nước ngoài tại Việt Nam như: Far East National Bank, Deutsche Bank AG, UFJ Bank, Citibank…