Trường THPT chuyên Chu Văn An được thành lập theo Quyết định số 310/QĐ-UBND, ngày 9 tháng 7 năm 1988 của UBND tỉnh Lạng Sơn. Ngoài các nhiệm vụ đã quy định tại Điều lệ trường trung học, nhà trường còn có các nhiệm vụ bồi dưỡng và phát triển năng khiếu của HS về các bộ môn chuyên; đồng thời bảo đảm thực hiện đầy đủ chương trình giáo dục cấp THPT với mục tiêu giáo dục toàn diện; tổ chức hướng dẫn HS làm quen với nghiên cứu khoa học, ứng dụng các thành tựu khoa học công nghệ phù hợp với điều kiện của trường và tâm sinh lý HS; hợp tác với các cơ sở giáo dục, nghiên cứu khoa học trong và ngoài nước trong cùng lĩnh vực chuyên môn để phục vụ việc nâng cao chất lượng đào tạo.
Trong những năm qua, tập thể đội ngũ CBQL và GV, nhân viên trong nhà trường luôn đoàn kết, nỗ lực phấn đầu, hoàn thành xuất sắc các kế hoạch phát triển giáo dục. Chất lượng dạy học và giáo dục không ngừng được nâng cao. Số lượng, chất lượng giải HS giỏi cấp tỉnh, cấp quốc gia tăng; tỷ lệ HS đỗ tốt nghiệp loại khá, giỏi, HS thi đỗ vào các trường đại học ngày càng cao.
Ngoài công tác dạy và học, nhà trường còn tích cực tham gia các cuộc vận động, phong trào thi đua như cuộc vận động “Hai không”, cuộc vận động “Học tập và làm theo tấm gương đạo đức Hồ Chí Minh”, phong trào thi đua “Xây dựng trường học thân thiện, HS tích cực”. Công tác giáo dục đạo đức, giáo dục pháp luật, giáo dục kỹ năng sống đã được nhà trường bước đầu quan tâm nhằm góp phần xây dựng môi trường giáo dục lành mạnh, không có bạo lực, không có tệ nạn xã hội, nhà trường luôn xanh, sạch, đẹp.
Trong suốt 25 năm kể từ khi thành lập đến nay, trường luôn là đơn vị đứng đầu về thành tích giáo dục của tỉnh Lạng Sơn, là địa chỉ tin cậy của nhân dân các dân tộc trong tỉnh.
Với những thành tích đã đạt được, nhà trường đã vinh dự đón nhận những phần thưởng cao quý của UBND tỉnh, thành phố, Bộ GDĐT và Sở GDĐT Lạng Sơn. Năm 1998, nhà trường nhận Huân chương lao động Hạng Nhì do Nhà nước trao tặng. Nhiều năm liền trường đạt danh hiệu Đơn vị tiên tiến xuất sắc dẫn đầu trong khối trường THPT của tỉnh. Nhà trường được công nhận là trường chuẩn quốc gia và đạt tiêu chuẩn kiểm định chất lượng giáo dục vào năm 2011. Năm 2013, nhà trường vinh dự được Nhà nước tặng thưởng Huân chương Lao động Hạng Nhất, được UBND tỉnh tặng cờ thi đua đơn vị dẫn đầu khối các trường THPT.