- Nguyên nhân chủ quan:
+ Công tác quản lý thuế đối với NTNN chưa có bộ phận quản lý, theo dõi riêng mà bị lồng ghép trong các phòng chức năng khác, thời gian dành
74
cho nhiều công việc khác nhau nên việc tìm hiểu các chính sách thuế liên quan đến NTNN chưa được đầu tư đúng mức, không mang tính chất chuyên sâu nên hiệu quả quản lý thuế chưa cao.
+ Do chưa có sự phối hợp chặt chẽ giữa các bộ phận chức năng trong cơ quan thuế, giữa ngành thuế với các cơ quan chức năng có liên quan như Hải quan, Kho bạc, Công an... dẫn đến những khó khăn trong việc xác định và quản lý hoạt động của NTNN.
+ Trình độ chuyên môn, nghiệp vụ của một bộ phận cán bộ, công chức thuế chưa đáp ứng được yêu cầu công việc, đặc biệt là công tác quản lý thuế NTNN. Kỹ năng về ngoại ngữ, tin học của cán bộ, công chức thuế chưa cao nên khó khăn trong việc kiểm tra, thanh tra thuế đối với các doanh nghiệp FDI nói chung và các NTNN nói riêng.
+ Mức độ tuân thủ các quy định về thuế NTNN của các đơn vị còn thấp, NNT chưa cập nhật thông tin chính xác và kịp thời về chính sách pháp luật nói chung và pháp luật thuế nói riêng để việc kê khai thuế được chính xác và đầy đủ. NNT chưa thật sự hiểu rõ về nghĩa vụ trong việc lập và báo cáo các nội dung của hồ sơ khai thuế. Việc hiểu biết và thực hiện các trình tự thủ tục pháp lý của NNT tại một số thời điểm và một số nội dung còn chưa đầy đủ dẫn đến có sự sai khác giữa số liệu kê khai với cơ quan thuế và số liệu thực tế phát sinh thu nhập. Có một số hành vi vi phạm phát sinh có tính liên tục từ năm này sang năm khác là do NNT chưa được cơ quan thuế kiểm tra, thanh tra thuế thường xuyên để NNT có thể điều chỉnh hành vi vi phạm.
- Nguyên nhân khách quan:
+ Để phù hợp với tình hình thực tiễn, hệ thống chính sách thường xuyên được bổ sung, điều chỉnh; tuy nhiên nhiều qui định còn mang tính chắp vá, thiếu chặt chẽ làm cho quá trình triển khai chưa thực sự thống nhất, gây khó khăn trong việc tuân thủ của các NTNN cũng như thực thi của các cán bộ, công chức thực hiện công tác quản lý thuế.
75
+ Bộ máy quản lý thuế còn hạn chế về chức năng cưỡng chế thuế, phần lớn mới chỉ dừng lại ở công tác tuyên truyền, hướng dẫn, đôn đốc nên hiệu quả tuân thủ của các NTNN chưa cao. Chính vì vậy mà ý thức chấp hành pháp luật thuế của các đối tượng nộp thuế chưa được nâng lên.
+ Môi trường đầu tư ngày càng thông thoáng, nhiều chính sách ưu đãi đầu tư nhằm thu hút các nhà đầu tư do vậy số lượng các doanh nghiệp nói chung và các doanh nghiệp FDI nói riêng gia tăng cả về số lượng và quy mô vốn đầu tư, trong khi nguồn nhân lực và các công cụ hỗ trợ tin học hoá chưa đáp ứng tương xứng.
+ Hệ thống công nghệ thông tin đang từng bước được hoàn thiện nhằm nâng cao hiệu quả công tác quản lý thuế nói chung, tuy nhiên mới phục vụ trong nội bộ ngành thuế, chưa liên kết được dữ liệu, thông tin từ các cơ quan quản lý khác của các NTNN để phối hợp quản lý được tốt hơn.