Hiện nay, hoạt động của đoàn thanh kiểm tra liên ngành về giống cây trồng được tổ chức 1 năm 2 lần hoặc kiểm tra đột xuất theo chương trình kế hoạch, nhiệm vụ phát sinh hay chỉ đạo của thành phố. Theo như quy định của nhà nước thì hoạt động kiểm tra giống cây trồng phải được thực hiện từ trung ương đến địa phương, từ cấp tỉnh, huyện xuống các xã, thị trấn. Phải có sự phối hợp, nhất quán giữa các cấp quản lý. Tuy nhiên, đây chỉ là lý thuyết còn thực tế thì việc phối hợp giữa các đơn vị là chưa chặt chẽ.
Hộp 4.4. Bất cập về sự phối hợp giữa các đơn vị chức năng quản lý giống cây trồng
“Sự liên kết giữa các đơn vị đã có cố gắng nhưng vẫn còn thiếu chặt chẽ trong công tác phối hợp. Hạn chế trong việc chia sẻ thông tin, kết quả xử lý vi phạm. Như vậy cần phải được sắp xếp sao hiệu quả trong công tác quản lý. Nên theo hướng một đầu mối một việc xuyên suốt và chỉ một đơn vị đó giải quyết, xử lý vấn đề. Không nên để xảy ra việc trách nhiệm chồng chéo giữa các đơn vị.”
Nguồn: Phỏng vấn Ông Lê Việt Hùng, Phó phòng Kinh tế huyện Gia Lâm lúc 16 giờ 30 phút này 22 tháng 04, tại Phòng kinh tế của UBND huyện Gia Lâm
Sự phối hợp giữa các đơn vị không được quy định rõ ràng, giao trách nhiệm cho một số hoạt động còn chồng chéo. Mỗi một hoạt động lại do một đơn vị phụ trách, như là công tác thanh kiểm tra các cơ sở sản xuất, kinh doanh do trạm
BVTV, phòng kinh tế huyện, đội quản lý thị trường cùng tiến hành kiểm tra. Nhưng phòng kinh tế huyện kiểm tra vệ sinh an toàn thực phẩm, trạm BVTV kiểm tra vật tư hàng hóa có trong cơ sở kinh doanh và đội quản lý thị trường kiểm tra cơ sở kinh doanh. Cuối cùng đơn vị tổng hợp những kết quả kiểm tra để báo cáo lên cấp trên chỉ có phòng kinh tế huyện, còn về độ chính xác của những kết quả kiểm tra đó thì phòng kinh tế huyện không thể nắm rõ được.
Từ đó thấy rằng hoạt động kiểm tra liên ngành phải là sự phối hợp giữa các đơn vị chức năng chuyên môn liên quan đến giống cây trồng như phòng kinh tế, trạm BVTV, đội quản lý thị trường, cán bộ chủa các HTX của xã, thị trấn, các câp chính quyền địa phương... Muốn có sự phối hợp nhịp nhàng giữa các đơn vị cần phải kịp thời chia sẻ thông tin, kết quả kiểm tra để góp phần làm giảm những trường hợp vi phạm.