PVEP cần rà soát và thay đổi một số quy định nội bộ để đảm bảo sự thống nhất với các quy định của PSC, JOA. Đồng thời có thể phân quyền xử lý quyết toán các dự án theo mức độ ít ưu tiên, mức độ ít quan trọng cho các bộ phận nghiệp vụ tuyến dưới để giảm tải cho đầu mối quản lý nhưng cần được giám sát chặt chẽ và kiểm soát lại bởi đầu mối quản lý. Điều chỉnh và làm thống nhất lại một số biểu mẫu, quy định để tránh cách hiểu không thống nhất và tiết kiệm nguồn lực (thời gian) cho chủ đầu tư khi lập báo cáo. Trong mỗi nhóm dự án (phát triển khai thác hay tìm kiếm thăm dò) có thể đưa lên một ví dụ điển hình về hồ sơ quyết toán chuẩn chỉnh (có thể xóa số liệu cụ thể) để các dự án khác làm theo hoặc rút kinh nghiệm
những sai sót không đáng có. Như vậy, quá trình quyết toán sẽ được diễn ra nhanh hơn và hiệu quả hơn cho cả chủ đầu tư và cả cơ quan quản lý của PVEP khi thẩm định và phê duyệt.
Ngoài ra, PVEP cần tăng cường, đẩy mạnh công tác quyết toán vốn đầu tư các dự án hoàn thành thông qua rà soát, phân loại hồ sơ các dự án hoàn thành chậm quyết toán; đánh giá, xác định rõ nguyên nhân chậm quyết toán, những khó khăn vướng mắc, đề xuất các biện pháp tháo gỡ khó khăn đối với từng trường hợp cụ thể; xác định rõ trách nhiệm của từng đơn vị, cá nhân liên quan, báo cáo lãnh đạo xem xét, xử lý. Đặc biệt, đối với các dự án chậm quyết toán do lỗi của nhà thầu, chủ đầu tư yêu cầu nhà thầu phối hợp để lập hồ sơ quyết toán, trường hợp nhà thầu không phối hợp thực hiện thì báo cáo, đề xuất biện pháp xử lý với cấp có thẩm quyền, đồng thời thông báo công khai trên các phương tiện thông tin đại chúng.
Bên cạnh đó, PVEP cần chỉ đạo sát sao hoạt động thẩm tra quyết toán vốn đối với các công trình thuộc thẩm quyền phê duyệt quyết toán; ưu tiên bố trí vốn để thanh toán đủ cho các dự án đã được phê duyệt quyết toán hoàn thành, đồng thời căn cứ vào điều kiện cụ thể để quyết định việc thuê kiểm toán thực hiện kiểm toán đối với các dự án. Quy định rõ trách nhiệm rà soát, báo cáo số lượng các dự án còn tồn đọng, chưa thực hiện quyết toán vốn theo quy định đối với cá nhân/bộ phận cụ thể; tổng hợp, báo cáo lãnh đạo PVEP, đồng thời tăng cường các giải pháp nhằm nâng cao hiệu quả công tác quyết toán, đảm bảo chất lượng, đúng thời gian, không để tồn đọng các dự án đã hoàn thành nhưng chưa thực hiện quyết toán.
PVEP giao nhiệm vụ cụ thể cho các bộ phận liên quan trong việc tham mưu, đề xuất các sáng kiến để nâng cao hiệu quả trong nghiệm thu, thanh toán khối lượng hoàn thành, chậm quyết toán và không thực hiện quyết toán dự án hoàn thành theo quy định.