Các Bộ, ngành, địa phương có vai trò quan trọng trong việc quản lý đầu tư XDCB, là cơ quan quản lý nhà nước trực tiếp về đầu tư XDCB, là cấp quyết định đầu tư dự án sử dụng nguồn vốn NSNN. Do đó, để nâng cao và sử dụng hiệu quả vốn đầu tư XDCB từ NSNN, tạo điều kiện thuận lợi cho công tác kiểm soát thanh toán vốn đầu tư XDCB của KBNN, các Bộ, ngành, địa phương cần phải:
- Xây dựng và ban hành đầy đủ các định mức, đơn giá về đầu tư XDCB, bổ sung, thay thế kịp thời những định mức, đơn giá đã lạc hậu, không sát với thực tế. Đây là một nội dung quan trọng để lập dự toán, dự án đầu tư và quản lý, kiểm soát chi, quyết toán vốn đầu tư XDCB thuộc nguồn vốn NSNN. Trong thời gian qua nhiều lĩnh vực, ngành nghề, công việc mới phát sinh nhưng chưa có định mức, đơn giá chuẩn ban hành hoặc nhiều định mức, đơn giá đã lạc hậu, không sát với thực tế đã ảnh hưởng không nhỏ đến công tác quản lý đầu tư XDCB của các cấp, các ngành.
- Trước khi ra quyết định phê duyệt dự án đầu tư, phê duyệt dự toán, phê duyệt kết quả đấu thầu, các bộ, ngành, địa phương phải xem xét tính hiệu quả (hiệu quả về kinh tế, xã hội, về môi trường...) của dự án đầu tư XDCB, phải bố trí đủ vốn cho các dự án đầu tư khi phê duyệt.
- Đối với công tác lập, phân bổ kế hoạch vốn phải bố trí vốn tập trung, tránh dàn trải, ưu tiên vốn cho những dự án cấp bách, dự án chuyển tiếp, dự án có tiến độ thực hiện tốt. Kiên quyết cắt giảm vốn những dự án không hiệu quả, đình hoãn những dự án chưa cần thiết phải khởi công. Đổi mới công tác bố trí kế hoạch vốn bằng công tác lập dự toán vốn cho dự án cùng với lập dự toán ngân sách hàng năm và phải dự kiến vốn cho các năm tiếp theo theo tổng mức đầu tư đã phê duyệt và tiến độ triển khai thực hiện dự án đã ghi trong quyết định đầu tư.
- Đôn đốc các chủ đầu tư khẩn trương lập và trình duyệt quyết toán vốn đầu tư dự án, công trình hoàn thành và khẩn trương phê duyệt quyết toán vốn đầu tư dự án, công trình hoàn thành đã có đầy đủ điều kiện, hồ sơ, thủ tục theo luật định để làm cơ sở cho KBNN thanh quyết toán và tất toán tài khoản cấp phát vốn đầu tư của dự án.