Những năm gần đây công tác thanh tra, kiểm tra quá trình quản lý và sử dụng NSNN đã được UBND thị xã Hương Thủy quan tâm chú trọng. Mục tiêu chủ yếu của việc thanh tra, kiểm tra việc quản lý và sử dụng NSNN tại thị xã Hương Thủy giai đoạn 2015-2018 là kiểm tra tính hợp pháp, hợp lệ của việc phân bổ, sử dụng NSNN; việc quản lý, sử dụng vốn đầu tư, vốn chương trình mục tiêu…; việc phân bổ, quản lý, sử dụng các khoản phát sinh, chi thường xuyên không có trong định mức theo quy định của UBND tỉnh, các khoản chi đảm bảo an sinh xã hội.
Để NSNN được sử dụng đúng mục đích, đúng đối tượng, chi tiêu tiết kiệm và có hiệu quả đòi hỏi cơ quan thụ hưởng ngân sách, cơ quan tài chính phải tăng cường trách nhiệm từ khâu lập dự toán, thẩm định và phê chuẩn dự toán. Đảm bảo dự toán được phê chuẩn phải có cơ sở khoa học, sát với thực tế nhiệm vụ chi của từng đơn vị, từng cấp ngân sách.
Công tác lập dự toán chi đúng theo biểu mẫu và thời gian quy định cho từng cấp ngân sách; việc phân bổ và giao dự toán cho các đơn vị đúng theo dự toán tỉnh giao. Tuy nhiên dự toán bổ sung điều chỉnh nhiều lần trong năm, nên việc theo dõi kiểm soát chi của KBNN không được thuận lợi.
Đối vối nguồn vốn chi đầu tư XDCB việc bố trí kế hoạch vốn đầu tư cho các dự án đảm bảo các điều kiện theo quy định của Luật NSNN và các văn bản pháp luật liên quan. Công tác lập và thẩm định phê duyệt dự án đầu tư, báo cáo kinh tế kỹ thuật chưa chi tiết rõ từng hạng mục công trình, nên trong quá trình thực hiện đầu tư phải điều chỉnh nhiều lần, công tác thẩm định và xác định tổng mức đầu tư chưa sát dẫn đến phải điều chỉnh tổng mức đầu tư nhiều lần làm tăng chi phí đầu tư. Công tác đấu thầu chưa phát huy hiệu quả, do tỷ lệ giảm thầu không đáng kể so với giá xét thầu được duyệt.
Đối với nguồn vốn chi thường xuyên việc quản lý điều hành chi ngân sách cơ bản chấp hành theo trình tự lập và giao dự toán chi theo quy định. Tuy nhiên trong quá trình thực hiện bổ sung, điều chỉnh nhiều lần mới sát với nhiệm vụ chi của đơn vị, các xã, phường. Việc chấp hành chế độ chính sách của đơn vị dự toán đúng mục đích và theo quy chế chi tiêu nội bộ của đơn vị. Công tác chi chuyển nguồn còn lớn cho thấy việc điều hành ngân sách và sử dụng ngân sách chưa kịp