Có thể nhận thấy qua dữ liệu khảo sát cũng như thực tiễn công tác tại đơn vị, bước đầu khi thực hiện khai thuế qua mạng NNT đã cảm nhận được lợi ích vượt trội của hình thức khai thuế này so với hình thức truyền thống. Đây cũng là một tín hiệu tốt trong tương lai để NNT có thể dễ dàng chấp nhận với các hình thức của dịch vụ thuế điện tử. Tuy nhiên có một bộ phận NNT cũng chưa thấy được mặt tiện ích của dịch vụ này. Hiện nay vấn đề thường được doanh nghiệp phản hồi là tính ổn định của trang web kê khai. Thật vậy, vì thông thường việc kê khai mạng được các doanh nghiệp thực hiện vào ngày 15-20 hàng tháng do vậy trong những ngày này website thường hay bị quá tải khiến nhiều doanh nghiệp không thể truy cập được. Thậm chí nhiều doanh nghiệp phải thuê người kê khai để chờ trang web kê khai khi nào truy cập được thì kê khai cho họ, dẫn đến nhiều bất cập trong doanh nghiệp trong công tác kê khai. Do vậy, để nâng cao sự hài lòng của doanh nghiệp thông qua các yếu tố này tác giả đề xuất một số hàm ý quản trị như sau:
Tổng cục thuế nên xem xét việc cải thiện chất lượng của máy chủ nhưng vẫn đảm bảo không quá tốn kém vì thực tế trong những ngày đầu của tháng thì website rất ít người truy cập sẽ gây ra tình trạng lãng phí. Công tác tuyên truyền một lần nữa cũng đóng vai trò quan trọng không kém vì một số doanh nghiệp thường khai báo chậm nên mới gây ra tình trạng website thường quá tải vào cuối tháng mà lại rất ổn định vào những ngày đầu tháng. Việc kê khai ngay khi phát sinh hóa đơn vừa giúp doanh nghiệp không phải sợ việc quá tải cuối tháng vừa giúp cơ quan thuế dễ quản lý website và giảm thiểu tối đa sự quá tải của máy chủ.