Để được hưởng ưu đã về thuế quan, hàng thủy hải sản của Việt Nam phải đáp ứng được yêu cầu về xuất xứ: Các mặt hàng phải đáp ứng được tiêu chí xuất xứ được quy định về cụ thể trong phụ lục 3b của FTA. Theo đó, mặt hàng cá sống ( mã HS 0301 ) có tiêu chí xuất xứ từ WO ( nghĩa là hàng hóa có xuất xứ thuần túy tại một bên theo điều 4.4 của FTA ); Các mặt hàng khác như cá tươi hoặc ướp lạnh ( 0304 ), Cá sấy khô, muối, hun khói…; các loại bột từ cá ( 0305 ), Động vật giáp xác ( 0306 ), Động vật thân mềm ( 0307 ) có tiêu chí xuất xứ là CC ( nghĩa là tất cả các vật liệu không có xuất xứ được sử dụng trong việc sản xuất các hàng hóa cuối cùng đã trải qua một sự thay đổi trong việc phân loại mã số thuế hàng hóa ở HS 2 chữ số. Các mặt hàng thủy sản chế biến như cá chế biến ( 1604 ) và Giáp xác và nhuyễn thể chế biến ( 1605 ) cũng có tiêu chí xuất xứ là CC, trừ một số mã hàng đặc biệt có tiêu chí xuất xứ là CC hoặc VAC 40% ( hàm lượng giá trị gia tăng được tính theo công thức quy định tại điều 4.5, không ít hơn 40% và quá trình sản xuất hàng hóa cuối cùng đã được thực hiện tại một bên ). Đó là các mặt hàng mã HS 1604149 ( từ cá ngừ, cá ngừ vằn, cá ngừ sọc dưa ) và 160419 ( loại khác). 160521 ( không đóng hộp kín khí ) 160529 ( loại khác ) và 160555 ( bạch tuộc ).
Đối với hàng thủy sản Việt Nam, rào cản lớn nhật đối với việc XK mặt hàng này sang thị trường Nga là các vấn đề về hàng rào kỹ thuật và các biện pháp an toàn vệ sinh thực phẩm và kiểm dịch động thực vật. Sau quá trình đàm phán và thống nhất, các bên quy định sử dụng các hiệp định TBT và SPS của WTO làm cơ sở thực hiện. Theo đó, hiệp định TBT và SPS được các bên áp dụng với những sửa đổi phù hợp. Tuy nhiên các bên vẫn có quyền soạn thảo các quy định phù hợp với tình hình thực tiễn, với các quy trình, tiêu chuẩn của nước mình, không vi phạm nguyên tắc của các hiệp định trên.