Công ty TNHH MTV Thoát nước được thành lập từ ngày 28/03/1973 với tên gọi đầu tiền là “Đội thoát nước” có nhiệm vụ quản lý vận hành hệ thống thoát nước thành phố, tập trung thoát nước tại bốn quận nội thành gồm có Hoàn Kiếm, Hai Bà Trưng, Đống đa, Ba Đình. Chặng đường xây dựng và phát triển của Công ty thoát nước có thể chia làm bốn giai đoạn phát triển chính:
• Giai đoạn khởi nghiệp 1973-1983:
Đội thoát nước được xây dựng có trụ sở tại 63 Vân Hồ quản lý khoảng 100 công nhân đến ngày 22/12/1973 được chuyển đổi thành Xí Nghiệp thoát nước Hà Nội. Trong giai đoạn này, nguồn lao động Xí nghiệp khá thưa thớt, cơ sở vật chất nghèo nàn, sơ sài. Công cụ dụng cụ lao động chủ yếu là công cụ cầm tay, thô sơ. Người lao động trực tiếp làm những công việc độc hại chưa được trang bị đầy đủ bảo hộ lao động gặp rất nhiều khó khăn trong công tác làm sạch môi trường thành phố.
• Giai đoạn từ năm 1983-1993:
Giai đoạn này, nguồn lực lao động có khoảng 650 người thực hiện việc quản lý, duy tu vận hành hệ thống thoát nước. Để nâng cao chất lượng công tác quản lý, Xí nghiệp đã tiến hành khảo sát, đo vẽ xây dựng lại toàn bộ hồ sơ kỹ thuật hệ thống cống, mương sông hồ ao thoát nước nội thành. Đồng thời chú trọng việc bồi dưỡng, phát triển nguồn nhân lực đôi với việc đầu tư thêm các thiết bị, máy móc hỗ trợ người lao động thực hiện công tác thu gom phế thải, nạo vét bùn rãnh cống ngầm, công ngang và mương sông. Vì vậy, Xí nghiệp ngày một lớn mạnh đến năm 1991 đã được UBND thành phố Hà Nội quyết định đổi thành Công ty Thoát nước Hà Nội.
• Giai đoạn 19930-2003
Trong thời gian này, hệ thống thoát nước thành phố được cải tạo, xây dựng cần có sự đảm bảo về việc thoát nước đô thị, thành phố triển khai hàng loạt các công trình thoát nước. Do vậy, đó là một khó khăn không nhỏ đối với Công ty. Để nâng cao chất lượng lao động, Công ty đã xây dựng tiêu chuẩn cấp bậc công nhân ngành. Xây dựng quy trình, quy phạm các công việc trong công ty. Công ty luôn đặt việc xây dựng nguồn lực lao động chất lượng để mang lại hiệu quả hoạt động cao. Với kết quả đã đạt được, năm 1996, Công ty đã được nhà nước tặng thưởng Huân chương lao động hạng nhất và năm 2003 được nhà nước tặng thưởng Huân chương độc lập hạng ba.
• Giai đoạn hiện nay:
Tốc độ đô thị hóa của thành phố không ngừng tăng lên với sự hình thành của một loạt các đô thị mới, các khu công nghiệp tập trung kèm theo sự gia tăng dân số làm cho nhu cầu thoát nước tăng lên nhanh chóng. Điều này gây áp lực lên hệ thống thoát nước, sông hồ trong vùng Hà Nội và các tỉnh lân cận. Mặt khác, lượng nước thải sinh hoạt chảy vào các hệ thống cống chung ngày càng tăng cao, xả trực tiếp vào sông hồ mà không qua xử lý. Chính vì vậy chất lượng nước tại các sông hồ đã bị ô nhiễm nặng nề ảnh hưởng tới sức khỏe cộng đồng, làm xấu đi cảnh quan đô thị và ảnh hưởng tới nhịp độ phát triển của Thành phố.
Vì vậy, cùng với tiến trình đô thị hóa, mở rộng thủ đô và nhu cầu bức thiết về thoát nước mưa, thu gom và xử lý phết thải, kết hợp với yêu cầu của Chính phủ theo nghị định về thoát nước đô thị, đòi hỏi Công ty Thoát nước phải nỗ lực phát triển để theo kịp tiến độ đô thị hóa nhanh chóng của Hà Nội. Do đó, lãnh đạo Công ty luôn cố gắng nâng cao cơ sở vật chất, nâng cấp máy móc thiết bị, nghiên cứu tìm tòi đề
ra các phương pháp nhằm xây dựng hệ thống thoát nước, xử lý nước thải hiệu quả. Hơn nữa, ban giám đốc cũng như khối quản lý công ty luôn cố gắng xây dựng môi trường làm việc tốt, tạo động lực lao động trong doanh nghiệp để đạt được hiệu quả cao nhất trong sản xuất kinh doanh, góp phần hoàn thiện hệ thống hạ tầng kỹ thuật của thủ đô, xứng đáng với tầm nhìn tương tai, góp phần xây dựng đất nước.