Nhiễm sắc thể số 17 của người có khoảng 81 triệu cặp base và có khoảng 1200 - 1500 gen, trong số đó, có một số gen liên quan đến các chỉ thị của khối u mà đặc biệt là gen mã hóa Cytokeratin có liên quan mật thiết với các khối u biểu mô đơn giản. Đáng chú ý hơn cả là Cytokeratin 19, một trong các cấu trúc sợi trung gian của bộ khung tế bào có liên quan đến sự duy trì cân bằng trong sự tăng sinh của tế bào biểu mô phổi [42], [76].
Kháng nguyên CYFRA21-1 là một phân đoạn của Cytokeratin 19, được tiết ra khi tế bào biểu mô phổi tăng sinh một cách bất thường trong ung thư, nên nó được đặt tên theo chữ viết tắt của từ Cytokeratin fragment (mảnh Cytokeratin) [43], [70], [91].
Cũng như các phân tử Cytokeratin khác, Cytokeratin 19 có cấu trúc vùng trung tâm với 4 vùng xoắn là 1A, 1B, 2A và 2B, kích thước khoảng 40 kDa, gồm 400 axit amin. Gen mã hóa cho Cytokeratin 19 nằm trên nhiễm sắc thể số 17 (Hình 1.3), có kích thước 4667 bp chứa 6 exon mã hóa cho phân tử mRNA kích thước 1382 bp (hình 1.3) [36], [41], [42].
Fujita (2004) [36] và cộng sự cho rằng Cytokeratin 19 bị cắt mất một phần đầu C trở thành CYFRA21-1 (37 kDa) có liên quan đến vị trí Met-Asp (367-368) nhạy cảm với một số protease (Hình 1.4).
Vì vậy, khi nghiên cứu CYFRA21-1 với vai trò là kháng nguyên đặc hiệu UTP, chúng tôi quan tâm chủ yếu đến phần epitope kháng nguyên CYFRA21-1. Theo một số kết quả nghiên cứu, khi sử dụng các phân tử kháng thể để nhận ra vùng epitope kháng nguyên của Cytokeratin, người ta nhận thấy, vùng epitope kháng nguyên CYFRA21-1 nằm trong khoảng axit amin từ 311 đến 368 trên phân tử Cytokeratin 19 [35], [41], [42].