Theo số liệu thống kê của Sở kế hoạch và Đầu tư tỉnh Phú Thọ tổng hợp về các doanh nghiệp đăng ký kinh doanh hàng năm, tính đến cuối năm 2008, toàn tỉnh có 2.079 doanh nghiệp ngoài nhà nước có giấy phép đăng ký kinh doanh (không tính 280 chi nhánh, văn phòng đại diện và số doanh nghiệp đã bị thu hồi giấy phép đăng ký kinh doanh). Trong đó có 312 doanh nghiệp tư nhân (tăng 91 doanh nghiệp so với năm 2005), 1023 công ty trách nhiệm hữu hạn (tăng 463 doanh nghiệp do với năm 2005), 668 công ty cổ phần (tăng 319 công ty do với năm 2005), 76 doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài (tăng 48 doanh nghiệp do với năm 2005); hiện đã có trên 1700 doanh nghiệp đã đi vào sản xuất kinh doanh. Chỉ tính riêng ở hai khu công nghiệp Thụy Vân và Bạch Hạc (thuộc thành phố Việt Trì) đã có 60 doanh nghiệp đang hoạt động (tăng 47 doanh nghiệp
so với năm 2005), trong đó có 14 doanh nghiệp trong nước (tăng 4 doanh nghiệp so với năm 2005), 21 doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài (tăng 9 doanh nghiệp so với năm 2005).
Tổng số vốn điều lệ của các doanh nghiệp ngoài nhà nước năm 2008 là16.287,193 tỷ đồng, tăng 2,35 lần so với năm 2005; bình quân số vốn điều lệ của mỗi doanh nghiệp là 7,8 tỷ đồng. Trong đó vốn điều lệ của các doanh nghiệp trong nước là 9.109,132 tỷ đồng, tăng 6.599,193 tỷ đồng so với năm 2005; số vốn điều lệ của các doanh nghiệp tư nhân là 286,134 tỷ đồng, bình quân 916 triệu đồng/1 doanh nghiệp; công ty trách nhiệm hữu hạn là 3.141,812 tỷ đồng, bình quân 3 tỷ đồng/1 công ty; công ty cổ phần là 5.681,183 tỷ đồng), bình quân 8,5 tỷ đồng/1 công ty. Vốn điều lệ của các doanh nghiệp có vốn đầu tư nước ngoài là 7.178,061 tỷ đồng, tăng 2.768,203 tỷ đồng so với năm 2005, bình quân 36,4 tỷ đồng/1 công ty.
Về quy mô: Số doanh nghiệp có vốn điều lệ từ 10 tỷ đồng trở lên chiếm 4,6%, từ 05 tỷ đến dưới 10 tỷ đồng chiếm 7,8%, từ 01 tỷ đồng đến dưới 05 tỷ đồng chiếm 41,5 %, còn lại là các doanh nghiệp có vốn điều lệ dưới 01 tỷ đồng.
Số doanh nghiệp có từ 10 lao động trở lên là 705 doanh nghiệp, chiếm tỷ lệ 33,9%. Trong đó, số doanh nghiệp có trên 500 lao động là 21 doanh nghiệp, chiếm tỷ lệ 1,1% so với tổng số doanh nghiệp; số doanh nghiệp có từ 300 đến 500 lao động là 06 doanh nghiệp, chiếm tỷ lệ 0,3%; số doanh nghiệp có từ 100 đến dưới 300 lao động là 84 doanh nghiệp, chiếm tỷ lệ 4%; số doanh nghiệp có từ 10 đến dưới 100 lao động là 594 doanh nghiệp, chiếm tỷ lệ 28,6%; còn lại là số doanh nghiệp có dưới 10 lao động, chủ yếu hoạt động dưới dạng hộ gia đình. Cá biệt cũng có những doanh nghiệp số lượng lao động khá đông, trên 3500 lao động như: Công ty Công ty trách nhiệm hữu hạn một thành viên Chè Phú Bền, Công ty Chè Phú Đa, Công ty Seeshin Việt Nam.
Nhìn chung ngành nghề đăng ký kinh doanh của các doanh nghiệp trong những năm qua đã có sự nhiều sự thay đổi, tỷ trọng doanh nghiệp hoạt động trong lĩnh vực thương mại, xây dựng thuần tuý có xu hướng giảm và chuyển dịch theo hướng đầu tư đa ngành, đa lĩnh vực, đặc biệt là những ngành nghề được bãi bỏ giấy phép hành nghề hoặc chứng nhận đủ điều kiện kinh doanh, tỷ trọng các đơn vị dịch vụ tiêu thụ sản phẩm, cung cấp vật tư hàng hóa phục vụ đời sống và sản xuất cho nhân dân vùng sâu, vùng xa,
nông thôn miền núi tăng lên đáng kể đã phản ảnh thực trạng phát triển của các doanh nghiệp bắt nguồn từ nhu cầu thực tiễn của thị trường, theo hướng thiết thực, hiệu quả, góp phần thúc đẩy tăng trưởng kinh tế và từng bước đáp ứng yêu cầu hội nhập. Các doanh nghiệp ngoài nhà nước đã có sự chuyển dịch cơ cấu ngành nghề kinh doanh theo hướng tích cực: Tỷ trọng doanh nghiệp đăng ký kinh doanh năm đến hết năm 2008 đã có sự thay đổi đáng kể trong hầu hết các lĩnh vực kinh doanh: Sản xuất công nghiệp - tiểu thủ công nghiệp là 18% (tăng 2%); xây dựng 20% (giảm 4%); thương mại, du lịch, dịch vụ 45% (tăng 8%) và khai thác, chế biến 12% (tăng 4%) so năm 2005, các ngành khác 5%.