Áp dụng cho cỏc dự ỏn ODA trong lĩnh vực cơ sở hạ tầng giao thụng để tạo điều kiện thu hỳt vốn vay một cỏch tớch cực hơn. Chớnh sỏch thuế hiện hành ỏp dụng đối với cỏc dự ỏn ODA được quy định theo nguyờn tắc đảm bảo vừa phự hợp với quy định của cỏc Luật thuế, vừa phự hợp với cam kết với cỏc nhà tài trợ là khụng dựng tiền tài trợ để nộp thuế. Cụ thể:
+ Đối với cỏc dự ỏn ODA vay, chủ dự ỏn phải nộp cỏc loại thuế phỏt sinh trong quỏ trỡnh thực hiện dự ỏn giống như cỏc chủ dự ỏn được đầu tư bằng cỏc nguồn vốn khỏc; Nguồn vốn để nộp thuế là từ vốn đối ứng trong nước.
+ Đối với dự ỏn viện trợ khụng hoàn lại, chủ dự ỏn được miễn hoàn toàn cỏc loại thuế giỏn thu (Thuế nhập khẩu, Thuế tiờu thụ đặc biệt, Thuế GTGT); cỏc loại thuế trực thu (Thuế thu nhập doanh nghiệp, Thuế thu nhập cỏ nhõn) được miễn nếu trong hiệp định tài trợ vốn ODA cú quy định.
Thời gian qua việc ỏp dụng chớnh sỏch thuế và hoàn thuế GTGT cũn cỳ vướng mắc như: khụng thống nhất, thiếu sự bỡnh đẳng trong việc thực hiện nghĩa vụ với ngõn sỏch nhà nước...Vỡ vậy, cần nghiờn cứu xõy dựng chớnh sỏch thuế đối với cụng trỡnh giao thụng sử dụng vốn ODA phự hợp hơn. Trước mắt cần:
+ Đỏnh giỏ đỳng đắn chớnh sỏch thuế hiện hành đối với cỏc dự ỏn ODA núi chung, và cỏc dự ỏn xõy dựng cụng trỡnh giao thụng bằng nguồn vốn ODA núi riờng.
+ Phõn loại cỏc dự ỏn ODA vay được ngõn sỏch cấp phỏt một phần, một phần cho vay lại; cỏc dự ỏn viện trợ khụng hoàn lại; cỏc dự ỏn sử dụng vốn ODA vay được NSNN cho vay cú sử dụng vốn đối ứng của ngõn sỏch để nộp cỏc loại thuế phỏt sinh trong quỏ trỡnh thực hiện dự ỏn; cỏc dự ỏn khụng sử dụng vốn đối ứng của ngõn sỏch để nộp thuế... từ đú đưa ra một thuế suất phự hợp cho từng loại, hoặc đưa ra chớnh sỏch miễn giảm thớch hợp đảm bảo nguyờn tắc vốn vay ODA khụng phải dựng cho nộp thuế, đồng thời đảm bảo tớnh bỡnh đẳng trong nộp thuế giữa cỏc đối tượng chịu thuế.
+ Hệ thống lại cỏc vướng mắc gặp phải khi thực hiện chớnh sỏch thuế trong quỏ trỡnh thực hiện dự ỏn.
+ Đề xuất hướng xử lý.