Việc điều tra thuế chỉ được thực hiện theo phương án điều tra thuế. Phương án điều tra phải do thủ trưởng cơ quan quản lý thuế phê duyệt, bao gồm đối tượng, nội dung, biện pháp áp dụng, thời hạn và người thực hiện điều tra thuế.
Công chức thuế, công chức hải quan là thanh tra viên, kiểm tra viên, kiểm tra viên chính, kiểm soát viên chính được thực hiện điều tra thuế.
- Điều... Trách nhiệm của cơ quan quản lý thuế trong việc thực hiện điều tra thuế điều tra thuế
Trong phạm vi nhiệm vụ, quyền hạn của mình, cơ quan quản lý thuế có trách nhiệm tổ chức thực hiện các biện pháp điều tra, ngăn chặn nhằm phát hiện, xử lý hành vi vi phạm pháp luật thuế.
- Điều... Thẩm quyền của cơ quan quản lý thuế trong việc thực hiện điều tra thuế
1. Yêu cầu tổ chức, cá nhân cung cấp thông tin, tài liệu phục vụ công tác điều tra thuế.
2. Tạm giữ hàng hoá, tang vật, phương tiện liên quan đến hành vi vi phạm pháp luật thuế.
3. Khám phương tiện vận tải, đồ vật liên quan đến hành vi vi phạm pháp luật thuế.
4. Khám nơi cất giấu tang vật, phương tiện vi phạm liên quan đến hành vi vi phạm pháp luật thuế.
5. Trưng cầu giám định.
6. Tiến hành các biện pháp nghiệp vụ khác theo quy định của pháp luật để thu thập chứng cứ, phát hiện, điều tra làm rõ hành vi vi phạm pháp luật thuế.
Có thẩm quyền điều tra thuế, nhƣng không cần thành lập bộ phận điều tra thuế chuyên trách trực thuộc cơ quan hải quan. Bởi vì, hiện tại cơ quan hải quan đã có lực lƣợng kiểm soát hải quan thực hiện chức năng chống buôn lậu và gian lận thƣơng mại, đồng thời đƣợc áp dụng các biện pháp kiểm soát hải quan đặc
thù giống nhƣ cơ quan điều tra. Cho nên, nhiệm vụ điều tra thuế chuyên trách có thể giao cho lực lƣợng kiểm soát hải quan.
Theo quy định của pháp luật tố tụng hình sự Việt Nam, cơ quan hải quan đƣợc giao thực hiện một số hoạt động điều tra đối với vụ việc có dấu hiệu buôn lậu, vận chuyển trái phép hàng hóa, tiền tệ qua biên giới. Nếu đƣợc bổ sung quyền thực hiện một số hoạt động điều tra đối với vụ việc có dấu hiệu trốn thuế, trong đó có khởi tố vụ án hình sự đối với hành vi trốn thuế, trách nhiệm của cơ quan hải quan sẽ đƣợc tăng cƣờng, hạn chế đƣợc các vi phạm pháp luật về thuế, đồng thời hiệu quả của việc xử lý các vi phạm pháp luật về thuế liên quan đến hàng hóa xuất nhập khẩu cũng sẽ cao hơn.