Ngân hàng Nông ngiệp và Phát triển Nông thôn Việt Nam - Chi nhánh huyện Mỏ Cày ( NHNN & PTNT - Chi nhánh huyện Mỏ Cày) được thành lập và chính thức đi vào hoạt động ngày 26/3/1998. Trụ sở được đặt tại khu phố 2, thị trấn Mỏ Cày, huyện Mỏ Cày, tỉnh Bến Tre. Ngân hàng Nông ngiệp và Phát triển Nông thôn Việt Nam - Chi nhánh huyện Mỏ Cày nằm ngay trung tâm huyện trên quốc lộ 60 là trung tâm kinh tế của huyện Mỏ Cày sẽ tạo ra điều kiện thuận lợi cho hoạt động của Ngân hàng.
Ngày 23/3/2009 huyện Mỏ Cày được tách ra làm 2 huyện là Mỏ Cày Bắc và Mỏ Cày Nam. Từ đó Ngân hàng được đổi tên thành Ngân hàng Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn Việt Nam - Chi nhánh huyện Mỏ Cày Nam. Ngân hàng Nông ngiệp và Phát triển Nông thôn Việt Nam - Chi nhánh huyện Mỏ Cày Nam chính thức hoạt động trên địa bàn 2 huyện Mỏ Cày Bắc và Mỏ Cày Nam với 3 phòng giao dịch là: phòng giao dịch Phước Mỹ Trung, phòng giao dịch Tân Trung và phòng giao dịch thị trấn Mỏ Cày.
Đến ngày 28/11/2013 Agribank - Chi nhánh huyện Mỏ Cày Bắc được khai trương trên quyết định thành lập số 2750/QĐ-HĐTV-TCTL ngày 10/10/ 2013 của Chủ tịch Hội đồng thành viên Agribank trên cơ sở nâng cấp Phòng giao dịch Phước Mỹ Trung trực thuộc Agribank - Chi nhánh huyện Mỏ Cày Nam (trước đây) thì NHNN & PTNT - Chi nhánh huyện Mỏ Cày Nam chỉ hoạt động trên địa bàn huyện Mỏ Cày Nam.
Ngân hàng Nông ngiệp và Phát triển Nông thôn Việt Nam - Chi nhánh huyện Mỏ Cày Nam là ngân hàng thương mại quốc doanh với sự quan tâm chỉ đạo của Agribank Bến Tre và Đảng ủy chính quyền địa phương cùng với sự cố gắng của tập thể cán bộ ngân hàng NHNN & PTNT - Chi nhánh huyện Mỏ Cày Nam ngày càng tạo được uy tín, khẳng định vị trí vai trò của mình trong việc góp phần xây dựng và phát triển kinh tế huyện.