Thực hiện đường lối đổi mới của Đảng, Nhà nước, ngành y tế trong những năm đổi mới đã không ngừng vươn lên, tạo được những chuyển biến mới về tư tưởng, phẩm chất chính trị và năng lực. Ngành đã xây dựng được một hệ thống tiêu chuẩn chức danh cho từng cấp lãnh đạo và viên chức thừa hành, trong đó có quy định rõ về phẩm chất chính trị.
Trong thực tế, đội ngũ cán bộ lãnh đạo chủ chốt và những viên chức thuộc thế hệ trước hầu hết đã được rèn luyện, thử thách trong quá trình đấu tranh cách mạng gian khổ nên họ đều có đầy đủ bản lĩnh chính trị vững vàng, kiên định với mục tiêu.
Còn lực lượng viên chức trẻ có kiến thức, tri thức khoa học thì ngay từ khi còn ngồi trên ghế nhà trường, bản thân họ đã được học tập, rèn
luyên, tu dưỡng phẩm chất chính trị, đạo đức của người thầy thuốc nên khi bước vào ngành họ lại càng có cơ hội để thử thách sự kiên định mục tiêu, sự trung thành với Tổ quốc, với nhân dân.
Trong điều kiện cơ chế thị trường, kinh tế nhiều thành phần, mở cửa với bên ngoài, viên chức nói chung và viên chức YTDP nói riêng hằng ngày, hàng giờ chịu sự tác động của nhiều nhân tố phức tạp do mặt mặt trái của cơ chế thị trường đem lại. Mặc dù gặp nhiều khó khăn và chịu tác động phức tạp trong điều kiện chuyển đổi kinh tế – xã hội nhưng đa số viên chức YTDP đã vượt qua khó khăn, cố gắng thực hiện và phấn đấu hoàn thành nhiệm vụ tốt nhiệm vụ chính trị được giao, giữ vững phẩm chất cách mạng, có ý thức tổ chức kỷ luật và tinh thần trách nhiệm, gắn bó mật thiết với nhân dân, góp phần đóng vai trò quyết định những thành tựu của sự nghiệp đổi mới đất nước và bảo vệ, chăm sóc sức khoẻ nhân dân.
Kết quả này một phần chính nhờ lãnh đạo ngành y tế đã thường xuyên quan tâm tới việc bồi dưỡng cho đảng viên và viên chức y tế quán triệt đường lối, chủ trương của Đảng, chính sách pháp luật của Nhà nước, nhiệm vụ chính trị của ngành, những kiến thức mới về chính trị, văn hoá xã hội và chuyên môn nghiệp vụ, đảm bảo sự thống nhất về chính trị tư tưởng và hành động trong toàn ngành.
Bên cạnh mặt mạnh là cơ bản và chủ yếu, đội ngũ viên chức YTDP vẫn còn những hạn chế, thiếu sót nhất định. Về chính trị, tư tưởng, còn một số viên chức thiếu an tâm học tập, rèn luyện bản thân và công tác do nhận thức thiếu sâu sắc, chưa đầy đủ về nhiệm vụ chính trị của ngành trong giai đoạn mới; chưa nâng cao ý thức trách nhiệm đối với vai trò “phòng bệnh hơn chữa bệnh”; một số ít bộ phận viên chức né tránh, thiếu bản lĩnh đấu tranh với những hành vi quan liêu, tham nhũng, tiêu cực... Tình trạng tiêu cực, tham nhũng còn phát sinh trong quản lý, sử dụng kinh phí nhà nước, xây dựng cơ bản, mua sắm trang thiết bị...