Hiệu quả sản xuất - xây dựng kinh tế của doanh nghiệp quân đội cần phải đƣợc xem xét tổng hợp giữa hiệu quả kinh tế và hiệu quả quốc phòng. Đối với các doanh nghiệp quốc phòng chuyên sản xuất vũ khí và trang bị cho quân đội, các doanh nghiệp kinh tế quân đội đứng trên địa bàn chiến lƣợc ở vùng sâu, vùng xa, biên giới, hải đảo thì hiệu quả hoạt động trƣớc hết biểu hiện ở việc bảo toàn và phát triển năng lực của doanh nghiệp, làm cho đơn vị đứng vững và từng bƣớc vƣơn lên trong cơ chế thị trƣờng, tạo ra đƣợc thế bố trí chiến lƣợc của đất nƣớc về kinh tế-quốc phòng-an ninh -văn hóa-xã hội. Còn đối với các doanh nghiệp quân đội chuyên làm kinh tế, phải lấy hiệu quả kinh tế làm chính. Mọi kết quả của hoạt động sản xuất kinh doanh phải đƣợc hạch toán đầy đủ, và coi tồn tại và phát triển thông qua cạnh tranh trên thị trƣờng là biểu hiện quan trọng của sự cần thiết tồn tại các doanh nghiệp này.
Ngày 08-10-2013, Thủ tƣớng Chính phủ đã có văn bản số 1604/TTg- ĐMDN về việc phê duyệt Đề án Sắp xếp, đổi mới doanh nghiệp 100% vốn Nhà nƣớc thuộc BQP. Theo đó, từ nay đến năm 2015, BQP sẽ phát huy kết quả đã đạt đƣợc và tiếp tục thực hiện chủ trƣơng đẩy mạnh đổi mới, sắp xếp và phát triển các DNQĐ theo Quyết định của Thủ tƣớng Chính phủ.
Yêu cầu của tiến trình đổi mới và hội nhập kinh tế quốc tế đang đòi hỏi các doanh nghiệp Việt Nam nói chung, DNQĐ nói riêng phải tích cực, chủ động nâng cao hơn nữa hiệu quả và năng lực cạnh tranh, tranh thủ thời cơ, vƣợt qua thách thức, tận dụng mọi cơ hội do hội nhập mang lại để phát triển nhanh và bền vững. Đây cũng là tiền đề quan trọng để các DNQĐ đẩy nhanh tiến độ sắp xếp, đổi mới và phát triển doanh nghiệp, tìm ra hƣớng đi mới thúc đẩy tăng trƣởng, góp phần quan trọng vào công cuộc xây dựng và bảo vệ Tổ quốc.