1. Trang chủ
  2. » Giáo Dục - Đào Tạo

Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam

93 6 0

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Thông tin cơ bản

Tiêu đề Đánh Giá Giá Trị Sử Dụng Của 2 Bộ Kit Xét Nghiệm Chẩn Đoán SARS-CoV-2 Được Sử Dụng Phổ Biến Ở Việt Nam
Tác giả Vũ Ngọc Hoàng
Người hướng dẫn TS. Nguyễn Thị Minh Xuân
Trường học Đại học Bách Khoa - ĐHĐN
Chuyên ngành Công Nghệ Sinh Học
Thể loại luận văn thạc sĩ
Năm xuất bản 2022
Thành phố Đà Nẵng
Định dạng
Số trang 93
Dung lượng 4,09 MB

Nội dung

1 ĐẠI HỌC ĐÀ NẴNG TRƯỜNG ĐẠI HỌC BÁCH KHOA VŨ NGỌC HOÀNG ĐÁNH GIÁ GIÁ TRỊ SỬ DỤNG CỦA BỘ KIT XÉT NGHIỆM CHUẨN ĐOÁN SARS-COV-2 ĐƯỢC SỬ DỤNG PHỔ BIẾN Ở VIỆT NAM LUẬN VĂN THẠC SĨ CÔNG NGHỆ SINH HỌC Đà Nẵng – Năm 2022 ĐẠI HỌC ĐÀ NẴNG TRƯỜNG ĐẠI HỌC BÁCH KHOA VŨ NGỌC HOÀNG ĐÁNH GIÁ GIÁ TRỊ SỬ DỤNG CỦA BỘ KIT XÉT NGHIỆM CHUẨN ĐOÁN SARS-COV-2 ĐƯỢC SỬ DỤNG PHỔ BIẾN Ở VIỆT NAM Chuyên ngành: Công nghệ sinh học Mã số : 8420201 LUẬN VĂN THẠC SĨ NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: TS NGUYỄN THỊ MINH XUÂN Đà Nẵng – Năm 2022 LỜI CẢM ƠN Trong suốt thời gian học tập, nghiên cứu thực luận văn Thạc sĩ, Tôi nhận quan tâm, động viên, hướng dẫn tận tình q Thầy Cơ, gia đình bạn bè Để hồn thành luận văn này, Tôi xin chân thành gửi lời cảm ơn đến: Tồn thể q Thầy Cơ khoa Hóa – Trường Đại học Bách Khoa Đà Nẵng tận tình truyền đạt kiến thức quý báu tạo điều kiện thuận lợi cho tơi suốt q trình học tập nghiên cứu Tôi xin chân thành bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc đến Cơ- TS Nguyễn Thị Minh Xn, Cơ hết lịng hướng dẫn, động viên, quan tâm tạo điều kiện tốt để tơi hồn thành luận văn Cảm ơn Ban Giám đốc Trung tâm Kiểm soát bệnh tật tỉnh Quảng Nam cho phép tạo điều kiện thuận lợi để tơi thực thử nghiệm phòng xét nghiệm Sinh học phân tử Trung tâm Cảm ơn giúp đỡ nhiệt tình ThS Nguyễn Trường Duy anh chị khoa Xét nghiệm suốt trình thực đề tài Thời gian vừa qua, gặp nhiều khó khăn q trình nghiên cứu đại dịch Covid-19, luận văn khơng tránh khỏi thiếu sót, Tơi mong nhận ý kiến đóng góp q Thầy Cơ Xin chân thành cảm ơn! Đà Nẵng, ngày tháng năm 2022 Học viên thực Vũ Ngọc Hoàng THƯ VIỆN TRƯỜNG ĐẠI HỌC BÁCH KHOA – ĐẠI HỌC ĐÀ NẴNG Lưu hành nội LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan đề tài “ Đánh giá giá trị sử dụng kít xét nghiệm chuẩn đốn SARS-CoV-2 sử dụng phổ biến Việt Nam” cơng trình nghiên cứu riêng hướng dẫn khoa học TS Nguyễn Thị Minh Xuân Các số liệu, kết nêu luận văn trung thực chưa cơng bố cơng trình khác Tơi xin hồn tồn chịu trách nhiệm lời cam đoan Người cam đoan Vũ Ngọc Hoàng THƯ VIỆN TRƯỜNG ĐẠI HỌC BÁCH KHOA – ĐẠI HỌC ĐÀ NẴNG Lưu hành nội ĐÁNH GIÁ GIÁ TRỊ SỬ DỤNG CỦA BỘ KIT XÉT NGHIỆM CHUẨN ĐOÁN SARS-COV-2 ĐƯỢC SỬ DỤNG PHỔ BIẾN Ở VIỆT NAM Học viên: Vũ Ngọc Hồng Chun ngành: Cơng nghệ Sinh học Mã số: 8420201 Trường Đại học Bách khoa - ĐHĐN Khóa: K40 Tóm tắt – Kể từ xuất vào cuối năm 2019 đến nay, virus SARS-CoV-2 gây dịch COVID-19 khiến 450 triệu người giới mắc bệnh, cướp sinh mạng triệu người, gây khủng hoảng y tế nghiêm trọng toàn cầu Các nhà khoa học tồn giới khơng ngừng nghiên cứu để tìm ta cơng cụ phát chuẩn đốn virus SARS-CoV-2 Cho đến nay, chẩn đốn phân tử dựa nucleic acid (xét nghiệm phản ứng chuỗi polymerase phiên mã ngược (RT-PCR)) coi tiêu chuẩn vàng để chẩn đốn sớm SARS-CoV-2 Tại Việt Nam, có nhà sản xuất cung cấp tự chủ kit xét nghiệm COVID-19 đưa vào sử dụng phịng sàng lọc bệnh là: Cơng ty cổ phần Cơng nghệ Việt Á với kít LightPower iVA SARS-CoV-2 1st RT-rPCR Công ty cổ phần Sao Thái Dương với kít one-Step RT-PCR Covid-19 Kit Thái Dương Nghiên cứu nhằm đánh giá giá trị sử dụng kít điều kiện thực tiễn, đánh giá ảnh hưởng yếu tố thường gặp phòng xét nghiệm Kết cho thấy kít có tính hiệu dụng cao với khả phòng trừ ngoại nhiễm sản phẩm PCR, việc nhiễm máu vào mẫu không ảnh hưởng tới kết phân tích, giá trị chu kỳ ngưỡng Ct (cycle threshold) tăng từ 4-6 chu kỳ tiến hành gộp mẫu lớn (1 mẫu dương 14 mẫu âm) Các giá trị Ct từ kit Việt Nam sản xuất tương đối gần với giá trị Ct kiểm nghiệm kit WHO cùng mẫu kiểm nghiệm Trên cùng mẫu kiểm nghiệm có khác biệt giá trị Ct kit (p

Ngày đăng: 20/10/2022, 20:53

HÌNH ẢNH LIÊN QUAN

DANH MỤC HÌNH Số hiệu  - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
hi ệu (Trang 13)
Hình 1.1: Minh họa cắt ngang của virus SARS-CoV-2 và bộ gen của nó [42] - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
Hình 1.1 Minh họa cắt ngang của virus SARS-CoV-2 và bộ gen của nó [42] (Trang 23)
Hình 1.2: Hình ảnh hiển vi điện tử truyền qua của virion SARS ‑ CoV ‑2 (màu đỏ) được phân lập từ một bệnh nhân trong đại dịch COVID-19 - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
Hình 1.2 Hình ảnh hiển vi điện tử truyền qua của virion SARS ‑ CoV ‑2 (màu đỏ) được phân lập từ một bệnh nhân trong đại dịch COVID-19 (Trang 26)
Hình 1.4: Sơ đồ phản ứng ức chế phản ứng PCR của các chất. - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
Hình 1.4 Sơ đồ phản ứng ức chế phản ứng PCR của các chất (Trang 36)
Bảng 1.1 Các gene mục tiêu được sử dụng trong bộ kit Sao Thái Dương [60b] - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
Bảng 1.1 Các gene mục tiêu được sử dụng trong bộ kit Sao Thái Dương [60b] (Trang 39)
Hình 2.1: Sơ đồ nghiên cứu - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
Hình 2.1 Sơ đồ nghiên cứu (Trang 41)
Bảng 2.1: Sinh phẩm xét nghiệm khẳng định SARS-Cov-2 được khuyến cáo bởi Tổ chức y tế thế giới  - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
Bảng 2.1 Sinh phẩm xét nghiệm khẳng định SARS-Cov-2 được khuyến cáo bởi Tổ chức y tế thế giới (Trang 42)
Bảng 2.4: Chu trình nhiệt chạy bằng kit Sao Thái Dương - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
Bảng 2.4 Chu trình nhiệt chạy bằng kit Sao Thái Dương (Trang 46)
Dựa vào bảng 3.1, có thể thấy rằng các kit được sản xuất tại Việt Nam đều cơ bản đáp ứng các yêu cầu kỹ thuật dành cho kit phát hiện SARS-CoV-2 bằng RT-PCR của  - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
a vào bảng 3.1, có thể thấy rằng các kit được sản xuất tại Việt Nam đều cơ bản đáp ứng các yêu cầu kỹ thuật dành cho kit phát hiện SARS-CoV-2 bằng RT-PCR của (Trang 52)
Hình 3.1: Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR của 3 mẫu thử nghiệm bằng bộ kít Việt Á  - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
Hình 3.1 Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR của 3 mẫu thử nghiệm bằng bộ kít Việt Á (Trang 56)
Hình 3.2: Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR của 3 mẫu thử nghiệm bằng bộ kít Sao Thái Dương  - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
Hình 3.2 Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR của 3 mẫu thử nghiệm bằng bộ kít Sao Thái Dương (Trang 57)
Hình 3.3: Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR của 3 mẫu thử nghiệm bằng sinh phẩm WHO  - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
Hình 3.3 Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR của 3 mẫu thử nghiệm bằng sinh phẩm WHO (Trang 57)
Hình 3.4: Biểu đồ so sánh giá trị Ct trung bình của các mẫu khi được phân tích bằng các kit khác nhau - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
Hình 3.4 Biểu đồ so sánh giá trị Ct trung bình của các mẫu khi được phân tích bằng các kit khác nhau (Trang 58)
Bảng 3.2 Độ chụm và khoảng tin cậy của độ chụm của 3 kit xét nghiệm - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
Bảng 3.2 Độ chụm và khoảng tin cậy của độ chụm của 3 kit xét nghiệm (Trang 59)
Các mẫu thử nghiệm cho kết quả như bảng sau: - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
c mẫu thử nghiệm cho kết quả như bảng sau: (Trang 61)
Hình 3.6: Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR lặp lại 3 lần đối với mẫu gây nhiễm loại 2 bằng bộ kít Sao Thái Dương - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
Hình 3.6 Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR lặp lại 3 lần đối với mẫu gây nhiễm loại 2 bằng bộ kít Sao Thái Dương (Trang 62)
Bảng 3.5: Bảng giá trị Ct của các mẫu gộp sau phản ứng Realtime RT-PCR bằng bộ kít Việt Á - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
Bảng 3.5 Bảng giá trị Ct của các mẫu gộp sau phản ứng Realtime RT-PCR bằng bộ kít Việt Á (Trang 64)
Bảng 3.8: Bảng kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR mẫu gây nhiễm máu bằng bộ kít Sao Thái Dương  - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
Bảng 3.8 Bảng kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR mẫu gây nhiễm máu bằng bộ kít Sao Thái Dương (Trang 66)
Bảng 3.7: Bảng kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR mẫu gây nhiễm máu bằng bộ kít Việt Á  - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
Bảng 3.7 Bảng kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR mẫu gây nhiễm máu bằng bộ kít Việt Á (Trang 66)
Bảng PL1.1: Kết quả Ct của các mẫu được chiết tách bằng các bộ kít khác nhau - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
ng PL1.1: Kết quả Ct của các mẫu được chiết tách bằng các bộ kít khác nhau (Trang 83)
Hình PL2.1: Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR bằng bộ kít Việ tÁ khi gộp 4, gộp 9, gộp 14 mẫu âm tính với 1 mẫu dương tính Sar-CoV- 2 - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
nh PL2.1: Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR bằng bộ kít Việ tÁ khi gộp 4, gộp 9, gộp 14 mẫu âm tính với 1 mẫu dương tính Sar-CoV- 2 (Trang 84)
Hình PL2.2: Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR bằng bộ kít Việ tÁ khi gộp mẫu- Mẫu 1 - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
nh PL2.2: Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR bằng bộ kít Việ tÁ khi gộp mẫu- Mẫu 1 (Trang 84)
Hình PL2.4: Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR bằng bộ kít Việ tÁ khi gộp mẫu-Mẫu 4  - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
nh PL2.4: Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR bằng bộ kít Việ tÁ khi gộp mẫu-Mẫu 4 (Trang 85)
Hình PL2.3: Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR bằng bộ kít Việ tÁ khi gộp mẫu- Mẫu 2 - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
nh PL2.3: Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR bằng bộ kít Việ tÁ khi gộp mẫu- Mẫu 2 (Trang 85)
Hình PL2.6: Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR bằng bộ kít Sao Thái Dương khi gộp mẫu- Mẫu 1 - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
nh PL2.6: Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR bằng bộ kít Sao Thái Dương khi gộp mẫu- Mẫu 1 (Trang 86)
Hình PL2.5: Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR bằng bộ kít Việ tÁ khi gộp mẫu-Mẫu 5  - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
nh PL2.5: Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR bằng bộ kít Việ tÁ khi gộp mẫu-Mẫu 5 (Trang 86)
Hình PL2.8: Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR bằng bộ kít Sao Thái Dương khi gộp mẫu- Mẫu 3 - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
nh PL2.8: Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR bằng bộ kít Sao Thái Dương khi gộp mẫu- Mẫu 3 (Trang 87)
Hình PL2.7: Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR bằng bộ kít Sao Thái Dương khi gộp mẫu- Mẫu 2 - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
nh PL2.7: Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR bằng bộ kít Sao Thái Dương khi gộp mẫu- Mẫu 2 (Trang 87)
Hình PL2.10: Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR bằng bộ kít Sao Thái Dương khi gộp mẫu-Mẫu 5  - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
nh PL2.10: Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR bằng bộ kít Sao Thái Dương khi gộp mẫu-Mẫu 5 (Trang 88)
Hình PL2.9: Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR bằng bộ kít Sao Thái Dương khi gộp mẫu-Mẫu 4  - Đánh giá giá trị sử dụng của 2 bộ kit xét nghiệm chẩn đoán SARS cov 2 được sử dụng phổ biến ở việt nam
nh PL2.9: Kết quả chạy phản ứng Realtime RT-PCR bằng bộ kít Sao Thái Dương khi gộp mẫu-Mẫu 4 (Trang 88)

TRÍCH ĐOẠN

TÀI LIỆU CÙNG NGƯỜI DÙNG

TÀI LIỆU LIÊN QUAN