Để đạt được các mục tiêu nêu trên, quản 1ý thuế đối với hàng hóa NK cần tuân thủ theo những nguyên tắc cơ bản sau:
Nguyên tắc tập trung dân chủ: Nội hàm của nguyên tắc này là: Bảo đảm đầy đủ các quy định trong các văn bản pháp luật về Thuế trong quá trình triển khai các biện pháp quản lý thu thuế; Thống nhất quy trình, nghiệp vụ quản lý thu thuế và vận dụng thống nhất các văn bản pháp luật về thuế; Thống nhất về trình tự, thời gian, yêu cầu và hình thức mẫu biểu trong lập dự toán và quyết toán thuế; Thống nhất việc chỉ đạo thu thuế từ. Trung ương đến địa phương; Phát huy tính chủ động,, linh hoạt của cơ sở trong việc khai thác nguồn thu từ thuế và xây dựng quy trình thu thuế. Quản lý thuế đối với hàng hóa NK phải tuân theo nguyên tắc tập trung dân chủ, nhằm tạo thuận lợi cho công tác quản lý và đảm bảo công bằng cho tất cả các đối tượng nộp thuế.
Nguyên tắc công khai minh bạch: Thu thuế 1à một hoạt động tài chính của Nhà nước có tác động rất lớn đến thu nhập, tiêu dùng, tiết kiệm và đầu tư của các doanh nghiệp Vì vậy, công khai minh bạch trong quản lý thuế là một trong những nguyên tắc nhằm phát huy được vai trò kiểm tra, kiểm soát của người nộp thuế, hạn chế được tiêu cực phát sinh trong quản 1ý thu thuế.
Nguyên tắc tiết kiệm, hiệu quả: nguyên tắc này đặt ra một yêu cầu quan trọng, đó là việc quản lý thu thuế phải đạt được số thu lớn nhất trong một mức chi phí thấp nhất có thể. Chi phi cho việc thực hiện, vận hành hệ thống thuế bao gồm cả chi phí của bộ máy quản lý thuế và chi phí tuân thủ của các đối tượng nộp thuế. Khi hệ thống thuế càng phức tạp thì chi phí vận hành càng lớnn và ngược lại, khi hệ thống thuế được thực hiện tốt thì chi phí quản lý thuế sẽ giảm. Vì vậy, nguyên tắc tiết kiệm, hiệu quả phải được quán triệt ngay từ khi xây dựng chính sách thuế sao cho đơn giản, dễ thực hiện va tiếp tục được duy trì trong quá trình thực hiện chính sách đó.
Nguyên tắc phù hợp, đồng thuận. Trong quá trình quản lý thu thuế đòi hỏi các biện pháp triển khai công tác thu thuế phải: Phù hợp với những quy định trong các văn bản pháp 1uật về thuế hiện hành; Phù hợp với với điều kiện kinh tế, xã hội của đất nước nói chung và tình hình thực tế sản xuất kinh doanh của các đối tượng nộp thuế nói riêng; Phù hợp với những quy định mang tính chất thông lệ quốc tế trong quản lý thuế được áp dụng phổ biến ở các nước. Điều này không chỉi giúp
cho chính sách thuế có tính khả khi mà còn đảm bảo nâng cao hiệu quả quản 1ý thuế