2.4.4.1. Quy trình thanh tra, kiểm tra thuế
Thực hiện Quyết định số 460/QĐ-TCT ngày 5/5/2009 của Tổng cục trưởng Tổng cục Thuế về công tác Thanh tra, Kiểm tra Thuế. Hàng năm, Cục Thuế Hà Tĩnh sẽ lập kế hoạch thanh tra thuế hàng năm. Danh sách đối tượng bị thanh tra thuế được sắp xếp theo mức độ rủi ro từ cao xuống thấp
Chậm nhất 15 ngày sau khi ký Quyết định thanh tra, Trưởng đoàn thanh tra sẽ công bố Quyết định thanh tra tại doanh nghiệp.
Khi thanh tra, doanh nghiệp sẽ được yêu cầu cung cấp sổ sách kế toán và hồ sơ tài liệu có liên quan. Từ đó, đoàn thanh tra tiến hành đối chiếu với tài liệu hiện có tại Cơ quan thuế, đối chiếu số liệu ghi chép trên chứng từ kế toán, sổ sách kế toán, báo cáo kế toán, báo cáo tài chính với hồ sơ khai thuế của doanh nghiệp và các quy định của pháp luật thuế để xác định việc chấp hành pháp luật của doanh nghiệp
Trường hợp chưa rõ, Đoàn thanh tra có thể yêu cầu doanh nghiệp giải trình thêm bằng văn bản hoặc tổ chức đối thoại, chất vấn.
Mỗi cuộc thanh tra thường kéo dài không quá 45 ngày làm việc, kể cả thời gian gia hạn
2.4.4.2. Kết quả thanh tra, kiểm tra thuế
Tăng cường công tác thanh tra, kiểm tra thuế, giai đoạn từ năm 2009 đến năm 2013 công tác kiểm tra, thanh tra được chú trọng cả về số lượng và hiệu quả; Thanh tra, kiểm tra thuế được thực hiện theo kế hoạch đầu năm và theo số liệu phân tích đánh giá kê khai thuế hàng tháng của DN, các doanh nghiệp có qui mô kinh doanh lớn, các
ngành nghề kinh doanh phức tạp, doanh nghiệp âm thuế kéo dài, kinh doanh thua lỗ và thanh tra, kiểm tra thuế doanh nghiệp có số thuế được miễn, giảm, giãn, hoàn thuế v.v...
Trên cơ sở kế hoạch thanh tra, kiểm tra thuế giai đoạn 2009 - 2013 đã được phê duyệt, căn cứ vào chức năng, nhiệm vụ các Chi cục Thuế, các phòng thanh tra, kiểm tra đã triển khai nhiệm vụ cụ thể cho từng cán bộ và các đoàn thanh tra, kiểm tra. Đã đề ra nhiều biện pháp thực hiện có hiệu quả vừa giảm bớt thời gian thanh tra, kiểm tra, nâng cao chất lượng các cuộc thanh tra, kiểm tra tại các DN; mặt khác xử lý nghiêm túc các trường hợp vi phạm chính sách thuế và phòng ngừa có hiệu quả các hành vi vi phạm. Thông qua công tác thanh tra, kiểm tra đã thu thêm nhiều tỷ đồng tiền thuế và khắc phục kịp thời tồn tại, đồng thời nâng cao ý thức trách nhiệm trong việc thực hiện chính sách thuế của đối tượng nộp thuế và quản lý của ngành thuế.
Kết quả sau 5 năm thực hiện (năm 2009- 2013) ngành thuế đã thực hiện kiểm tra thuế 2792 lượt ở các doanh nghiệp, số thuế phát hiện sau kiểm tra 277,9 tỷ đồng và phạt vi phạm hành chính 66,2 tỷ đồng, giảm lỗ 424,1 tỷ đồng, giảm khấu trừ thuế 1,27 tỷ đồng. Trong đó riêng các doanh nghiệp kinh doanh du lịch, ngành thuế đã tiến hành kiểm tra 38 doanh nghiệp, với số thuế phát hiện sau kiểm tra là 1,74 tỷ đồng và phạt vi phạm 443 triệu đồng.
Kiểm tra hoàn thuế: Kiểm tra hoàn thuế 1068 hồ sơ, trong đó kiểm tra trước hoàn 651 hồ sơ, kiểm tra sau hoàn thuế 417 hồ sơ; loại trừ thuế đầu vào không được khấu trừ 24,5 tỷ đồng, truy hoàn 415 triệu đồng. Riêng đôi với ngành du lịch, cơ quan thuế trên địa bàn Hà tĩnh đã kiểm tra hoàn thuế cho 58 hồ sơ.
Thanh tra thuế: Từ năm 2009 đến nay, ngành Thuế đã thực hiện thanh tra thuế 219 doanh nghiệp (trong đó có 12 doanh nghiệp kinh doanh du lịch), đạt bình quân 106,8% KH thanh tra Tổng cục Thuế giao; qua thanh tra phát hiện truy thu về cho ngân sách 26,5 tỷ đồng tiền thuế, xử phạt vi phạm hành chính 4,1 tỷ đồng, điều chỉnh giảm lỗ 25,5 tỷ đồng.
Những phát hiện sau kiểm tra, thanh tra thuế chủ yếu là do một số doanh nghiệp nhận thức chưa đầy đủ trách nhiệm và nghĩa vụ trong công tác thuế, phản ánh không kịp thời doanh số phát sinh và số thuế phải nộp, lập chi phí đầu vào lớn v.v...với mục đích tăng số thuế được khấu trừ và làm giảm số thuế phải nộp. Việc không thực hiện nghiêm túc pháp luật thuế của người nộp thuế đã gây ra những khó khăn cho công tác quản lý của ngành thuế, làm giảm tác dụng của chính sách thuế.