Hoạt động du lịch hiện nay thuộc sự quản lý của cơ quan Nhà nước Trung ương là Bộ Văn hóa, Thể thao và Du lịch.
Được quy định tại Điều 3 Nghị định số 185/2007/NĐ-CP ngày 25 tháng 12 năm 2007 quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của Bộ Văn hoá, Thể thao và Du lịch. Hiện nay, Bộ Văn hóa, Thể thao và Du lịch bao gồm 22 đơn vị quản lý Nhà nước. Trong đó, Tổng cục Du lịch là cơ quan chuyên trách Trung Ương về hoạt động Du lịch. Tại các tỉnh, thành, là các Sở Văn hóa, Thể thao và Du lịch. Tại cấp huyện, các phòng Văn hóa, Thể thao và Du lịch quản lý trực tiếp hoạt động du lịch tại cơ sở.
Ngoài ra, có liên quan đến hoạt động quản lý Nhà nước về Du lịch còn có Ban quản lý Làng Văn hóa - Du lịch các dân tộc Việt Nam. Là cơ quan trực thuộc Bộ Văn hoá, Thể thao và Du lịch, thực hiện chức năng quản lý nhà nước trực tiếp đối với Làng Văn hóa - Du lịch các dân tộc Việt Nam theo quy định của pháp luật.
Các đơn vị lữ hành thuộc sự quản lý của cơ quan Nhà nước về Du lịch trực tiếp tại địa phương. Đây chính là nhân tố cầu nối đưa du khách đến với nghệ thuật múa rối. Họ là những người tiếp xúc trực tiếp với du
khách. Họ sẵn sàng quảng bá hình ảnh múa rối nước trong các sản phẩm du lịch của đơn vị. Như vậy, tuy không có vai trò quản lý hoạt động múa rối nước, song các đơn vị lữ hành ảnh hưởng rất lớn đến việc khai thác nghệ thuật múa rối nước trong du lịch.