thời gian ủ mẫu, và lựa chọn muối dùng trong tủa DNA. Các sản phẩm tách chiết DNA được kiểm tra sơ bộ bằng kỹ thuật điện di trên gel agarose 1% cho tín hiệu tương đối rõ ràng (Hình 3.4).
Trong các lần khảo sát, ở các thí nghiệm khảo sát ba mức nhiệt độ ủ mẫu khác nhau, mẫu ủ ở 50ºC cho băng DNA sáng hơn và giảm dần so với các mẫu được ủ ở nhiệt độ 56ºC và 65ºC (Bảng 3.6 và Hình 3.4, A). Ngồi ra, mẫu được ủ ở 56ºC cho băng DNA sáng hơn so với 65ºC, nhưng cả hai mẫu này đều không tinh sạch (tỷ số OD260/OD280 là 1,46-1,6). Nồng độ DNA thu được từ mẫu ủ ở 50ºC thường ở trong khoảng 4,45 ng/µl. Ở các nhiệt độ cao, DNA khơng tinh sạch và có tín hiệu khơng cao có thể được giải thích do sự giảm hoạt tính của proteinase K làm cho protein trong tế bào không được phân hủy tốt khiến DNA không được giải phóng ra khỏi nhân, ty thể, hoặc phức hợp DNA-protein.
Bảng 3.6: So sánh DNA thu được ở các nhiệt độ ủ mẫu khác nhau Nhiệt độ ủ mẫu Nhiệt độ ủ mẫu 50oC 56oC 65oC Độ sáng băng DNA Lần 1 26,2 22,1 16,8 Lần 2 29,9 24,8 19,7 Lần 3 32,5 27,7 22,3 Trung bình 29,5 ± 3,17 24,9 ± 2,8 19,6 ± 2,75 OD260/OD280 Lần 1 1,78 1,55 1,6 Lần 2 1,82 1,46 1,58 Lần 3 1,82 1,53 1,55 Trung bình 1,81 ± 0,02 1,51 ± 0,05 1,58 ± 0,03 Đối với các thí nghiệm khảo sát các nhiệt độ ủ mẫu, DNA tách được trong điều kiện ủ mẫu với proteinase K ở nhiệt độ 50ºC trong thời gian 60 phút cho tín hiệu yếu hơn nhiều so với ủ mẫu trong thời gian 40 phút (Bảng 3.7 và Hình 3.4, B).
Tuy nhiên, trong trường hợp đầu, DNA thu được có độ tinh sạch cao (OD260/OD280 khoảng 1,83) và nồng độ vừa phải (3,25 ng/µl). Trong khi đó, dịch DNA thu được