Đây là một yếu tố vô cùng quan trọng đối với các doanh nghiệp sản xuất kinh doanh xuất khẩu thuỷ sản vì hoạt động của các Công ty chịu sự tác động trực tiếp của điều kiện tự nhiên.
Một đặc điểm nổi bật của ngành thuỷ sản là tính mùa vụ, vào những tháng mùa vụ việc tìm kiếm nguồn nguyên liệu rất thuận lợi. Tuy nhiên khi kết thúc mùa vụ nguồn nguyên liệu lại rất khan hiếm ảnh hưởng đến tiến độ sản xuất của Công ty. Một thuận lợi lớn của Công ty là được thành lập trên địa bàn tỉnh Khánh Hoà, địa bàn được thiên ưu đãi có nhiều tiềm năng phát triển ngành thuỷ sản, chỉ đứng sau Cà Mau, An Giang,Cần Thơ.
Ngày nay nhu cầu về mặt hàng thuỷ sản của người tiêu dùng là rất lớn, nhất là trong vài năm gần đây khi xảy ra nhiều đại dịch nh ư: cúm gia cầm, bệnh lở mồm long móng ở gia súc,dịch heo tai xanh đã làm cho nhiều cá nhân tổ chức chuyển sang kinh doanh các mặt hàng thuỷ hải sản vừa an toàn vừa hiệu quả. Thế nhưng, chính điều này cũng ảnh hưởng lớn theo chiều hướng tiêu cực với nhóm sản phẩm thức ăn, thuốc thú y gia cầm, gia súc của C ông ty. Đặc biệt trong năm 2005, doanh thu của nhóm sản phẩm này giảm đáng kể vì đại dịch phát triển rộng rãi, số lượng khách hàng của công ty giảm đáng kể.
Đồng thời, môi trường tự nhiên ngày càng bị ô nhiễm đã đem lại không ít khó khăn cho các doanh nghiệp thuỷ sản đó là sự cạn kiệt của các nguồn lợi thuỷ sản tự nhiên do khai thác quá mức và sự thiếu ý thức bảo vệ tài nguyên của con người.