bằng đường biển chi viện chiến trường, kịp thời bảo đảm vũ khí, trang bị cho quân và dân miền Nam giành nhiều thắng lợi, góp phần làm chuyển biến cục diện chiến trường ngày càng có lợi cho ta, đưa cuộc kháng chiến chống Mỹ, cứu nước tiến thêm một bước mới.
Từ tháng 4 năm 1962 đến tháng 12 năm 1963, các đội tàu đã vận chuyển được 1.318,68 tấn vũ khí vào các tỉnh miền Tây Nam Bộ (Cà Mau, Bến Tre, Bạc Liêu, Trà Vinh). Đây là một chiến công vô cùng lớn, góp phần làm nên những chiến thắng liên tiếp của quân và dân miền Nam thời kỳ này.
Số lượng vũ khí lớn chi viện kịp thời còn tạo điều kiện cho lực lượng vũ trang chiến đấu, đập tan cuộc càn qt "Sóng tình thương" ở vùng Năm Căn (Cà Mau) kéo dài nhiều đợt trong thời gian từ năm 1962 đến năm 1963.
Được trang bị tương đối đầy đủ về vũ khí, các tỉnh miền Trung và miền Tây Nam Bộ đã phá tan nhiều cuộc càn quét của địch, nhổ nhiều đồn bốt và mở rộng thêm vùng giải phóng, đẩy mạnh phong trào cách mạng. Trong một thời gian ngắn, hai tỉnh Cà Mau, Bến Tre tuyển được 2.000 quân, xây dựng được 2 trung đoàn chủ lực.
Đặc biệt, nhờ có số vũ khí được Trung ương chi viện kịp thời, quân và dân tỉnh Mỹ Tho đã làm nên chiến thắng Ấp Bắc ngày 2 tháng 1 năm 1963 đánh bại chiến thuật "trực thăng vận", "thiết xa vận" của Mỹ - nguỵ. Trong trận Ấp Bắc, hai đại đội Qn giải phóng cùng du kích và nhân dân đã đánh bại trận càn lớn của địch với 2.000 tên, có xe tăng và máy bay yểm trợ; loại khỏi vòng chiến đấu 450 tên, bắn cháy 3 xe tăng, bắn rơi và phá huỷ 14 trực thăng. Chiến thắng Ấp Bắc góp phần đẩy chiến lược "Chiến tranh đặc biệt" với cơng thức "vũ khí, cố vấn Mỹ cộng quân nguỵ", đứng trước nguy cơ bị phá sản hoàn toàn.
Từ chuyến đi mở đường đến hết năm 1963, Đoàn 759 đã tổ chức được 28 chuyến, trong đó có 1 chuyến trinh sát và 2 chuyến bị mắc cạn ở quần đảo Trường Sa, cịn lại đều đến đích, bảo đảm tuyệt đối an tồn và vẫn giữ được bí mật về con đường vận chuyển trên biển. Đây là một kỳ tích của cán bộ, chiến sĩ
Đoàn 759 dưới sự lãnh đạo tài tình và sáng suốt của Trung ương Đảng, Quân ủy Trung ương và Bộ Quốc phòng trong giai đoạn đầu cuộc kháng chiến chống Mỹ, cứu nước.
Tháng 12 năm 1963, Hội nghị Ban Chấp hành Trung ương Đảng lần thứ 9 (khoá III) đề ra phương hướng cho cách mạng miền Nam trong tình hình mới và nhấn mạnh phải "kết hợp đấu tranh chính trị với đấu tranh vũ trang một cách linh hoạt, đấu tranh chính trị và đấu tranh vũ trang đều đóng vai trị quyết định" nhưng "đấu tranh qn sự đóng vai trị quyết định trực tiếp" trong việc đánh tan lực lượng quân sự - chỗ dựa nền thống trị của địch, làm cho cách mạng thắng lợi. Để thực hiện yêu cầu đó "điều quan trọng nhất, quyết định nhất là trong bất cứ trường hợp nào, vẫn phải nỗ lực tăng cường lực lượng ta về mọi mặt, đặc biệt là lực lượng quân sự". [59; 827]
Quán triệt Nghị quyết Hội nghị Trung ương Đảng lần thứ 9 (tháng 12 năm 1963), Quân ủy Trung ương chủ trương đẩy mạnh công tác chi viện cho chiến trường miền Nam trong năm 1964.
Trước sự phát triển nhanh chóng và hoạt động vận chuyển đạt hiệu quả cao của Đoàn 759, để tạo thuận tiện cho Đoàn 759 trong thực hiện nhiệm vụ, phù hợp với công tác quản lý, xây dựng lực lượng và tổ chức vận chuyển chi viện miền Nam, tháng 8 năm 1963, Thường trực Quân ủy Trung ương quyết định chuyển Đoàn 759 từ Bộ Tổng Tham mưu về trực thuộc Cục Hải quân. Đảng ủy và Thủ trưởng Cục Hải quân có trách nhiệm lãnh đạo và chỉ huy Đoàn 759 toàn diện về mọi mặt, nhưng chỉ huy hành quân và liên hệ với chiến trường vẫn do Bộ Tổng Tham mưu chịu trách nhiệm. [31; 114]
Thực hiện quyết định của Thường vụ Quân ủy Trung ương, ngày 29 tháng 1 năm 1964, Bộ Quốc phòng ra quyết định (số 30 QP/QĐ) đổi tên Đoàn 759 thành Đoàn 125. [34; 112].
Ngày 19 tháng 2 năm 1964, Đoàn 125 chuyển về đóng quân tại số 106 -