Việc phân loại các đơn vị sự nghiệp công lập được dựa trên các căn cứ sau: -Ngành, lĩnh vực hoạt động của đơn vị sự nghiệp công lập;
-Chức năng, nhiệm vụ phục vụ quản lý Nhà nước hoặc thực hiện nhiệm vụ được giao và cung cấp dịch vụ công của đơn vị sự nghiệp công lập;
-Tính chất, đặc điểm về chuyên môn, nghiệp vụ của đơn vị sự nghiệp công lập; -Cơ chế hoạt động của đơn vị sự nghiệp công lập.
Hoặc dựa theo mức độ tự chủ tài chính của đơn vị sự nghiệp công lập có thể
phân loại thành hai loại đơn vị sự nghiệp như sau:
Đơn vị sự nghiệp công lập được giao quyền tự chủ hoàn toàn: Đây là loại đơn vị sự nghiệp công lập có quyền tự chủ hoàn toàn trong thực hiện nhiệm vụ, tài chính, tổ chức bộ máy, nhân sự.Đại diện cho nhóm đơn vị sự nghiệp công lập này là các công ty, tổng công ty trực thuộc Chính phủđược hoàn toàn tự quyết và vận dụng cơ chế tài chính như một doanh nghiệp nhưng theo qui định của pháp luật về cơ chế tự chủ của
đơn vị sự nghiệp công lập.
Đơn vị sự nghiệp công lập tự chủ một phần:Đây là loại đơn vị sự nghiệp công lập chưa được giao quyền tự chủ hoàn toàn trong thực hiện nhiệm vụ, tài chính, tổ
chức bộ máy, nhân sự. Như các đơn vị hoạt động trong các ngành, lĩnh vực sau: Trực tiếp thực hiện nhiệm vụ phục vụ quốc phòng, an ninh; xuất bản ( không bao gồm lĩnh vực in và phát hành xuất bản phẩm); sản xuất nội dung chương trình phát thanh, truyền hình, báo chí tại địa phương; quản lý, duy tu công trình đê điều, công trình phân lũ và các công trình phòng chống thiên tai; qui hoạch đô thị; hoạt động của thư viện, lưu trữ, bảo tàng và các hoạt động văn hóa khác; các đơn vị sự nghiệp công lập được thành lập
để phục vụ chức năng quản lý nhà nước của các Bộ, cơ quan ngang Bộ, cơ quan thuộc Chính phủ và các trường hợp khác theo quyết định của Thủ tướng Chính phủ.
Như vậy, theo 2 cách phân loại như trên thì Đơn vị sự nghiệp công lập giáo dục, đào tạo gồm:
Đơn vị sự nghiệp giáo dục, đào tạo được trao quyền tự chủ hoàn toàn về thực hiện nhiệm vụ, tổ chức bộ máy, nhân sự và tài chính;
Đơn vị sự nghiệp giáo dục, đào tạo được giao quyền tự chủ một phần và đơn vị
sự nghiệp giáo dục đào tạo chưa được giao quyền tự chủ.