Nội dung: Tự chủ tài chính trong các trong các đơn vị sự nghiệp công lập là việc các đơn vị này được quyền quyết định hoạt động tài chính của đơn vị.
Có thể nói tự chủ tài chính là yếu tố có tác động to lớn đến mọi mặt hoạt động của đơn vị, khâu cuối cùng trong tự chủở các đơn vị sự nghiệp công. Mức độ tự chủ
tài chính càng cao thì đơn vị càng có sự tự chủ cao trong triển khai thực hiện nhiệm vụ, tổ chức bộ máy, nhân sự. Việc trao quyền và trách nhiệm tự chủ tài chính cho các
đơn vị sẽ có tác dụng lan tỏa và tác động mạnh mẽ tới sự chuyển biến toàn diện các hoạt động của cảđơn vị: nâng cao chất lượng hoạt động, quản lý nhân lực, phát triển cơ sở vật chất, đầu tư và quản lý đầu tư, …
Quản lý tài chính trong trong các đơn vị sự nghiệp công lập trong lĩnh vực giáo dục đào tạo có những đặc điểm riêng biệt vì đầu tư của trong các đơn vị này chủ yếu dành cho việc tạo dựng nguồn nhân sự, các hoạt động sự nghiệp. Tự chủ tài chính là việc tự chủ trong các hoạt động tài chính bao gồm:
-Tự chủ về giá, phí
-Tự chủ trong chi thường xuyên và đầu tư
-Tự chủ trong chi tiền lương và thu nhập tăng thêm -Trích lập các quĩ
-Tự chủ trong giao dịch tài chính
Trong số các nội dung của tự chủ tài chính trong các đơn vị sự nghiệp công lập, việc quản lý thu nhập và chi tiêu tài chính là những vấn đề quan trọng nhất. Về các nguồn thu của các các đơn vị sự nghiệp công lập, đó là những khoản kinh phí mà đơn vị nhận được không phải hoàn trả, dùng để triển khai hoạt động giáo dục đào tạo, nghiên cứu khoa học và các hoạt động khác theo đúng luật định.
Về các khoản chi của các đơn vị sự nghiệp công lập bao gồm: (1) Chi sự
nghiệp, (2) Chi hoạt động kinh doanh, (3) Chi cho xây dựng cơ bản, và (4) Chi bổ trợ
cho các đơn vị trực thuộc.
Thu nhập của các đơn vị sự nghiệp công lập bao gồm: (1) Nguồn thu do Ngân sách nhà nước cấp, (2) Nguồn thu sự nghiệp, (3) Nguồn thu từ hoạt động kinh doanh, và (4) Thu nhập khác.
Mức độ tự chủ: Tự chủ tài chính của đơn vị sự nghiệp được chia theo 4 mức độ: -Tự chủ tài chính đối với đơn vị tự bảo đảm chi thường xuyên và chi đầu tư; -Tự chủ tài chính đối với đơn vị tự bảo đảm chi thường xuyên;
-Tự chủ tài chính đối với đơn vị tự bảo đảm một phần chi thường xuyên (do giá, phí dịch vụ sự nghiệp công chưa kết cấu đủ chi phí, được Nhà nước đặt hàng, giao nhiệm vụ cung cấp dịch vụ sự nghiệp công theo giá, phí chưa tính đủ chi phí);
-Tự chủ tài chính đối với đơn vị được nhà nước bảo đảm chi thường xuyên ( theo chức năng, nhiệm vụ được cấp có thẩm quyền giao, không có nguồn thu hoặc nguồn thu thấp)